公司已经申报纳税后没有发工资属于违法的行为。职工可以向有关部门进行投诉。而且企业应当在职工为其提供服务的会计期间，将应付的职工薪酬确认为负债，除因解除与职工的劳动关系给予的补偿外，应当根据职工提供服务的受益对象。
公司已报税但没发工资的原因可能有以下几种情况：
（1）工资数据被用人单位人力资源代报提交到了个税系统；
（2）用人单位的相关人员将其进行了代报，工资的交接有一定的延迟，所以个人所得税系统上会有，但现实中却未发放，具体情况需咨询单位，并尽快到单位对工资进行交接。
（3）合并发放多个月的工资。有时候企业由于资金困难,或者天灾人祸,可能没办法及时发放工资.等到企业正常的时候,就会在一个月内合并发放数个月的工资。遇到合并发放多个月的工资的时候,我们先向税局说明情况,最好有书面说明,就等于像是具备了一个案。向税局说明情况之后,正常申报未按时发放的工资,虽然实际上没有发放,但是也可以正常申报个人所得税.
合并发放工资的当月,把以往应发而未发放的工资剔除,再申报剩余工资的个人所得税。
（4）补发以前的工资。还有一种情况,以前的工资已经正常申报了,个人所得税也正常缴纳了.但由于公司对员工以往的工资做了相应的调整,需要补发以前的工资。
这种情况也需要向税局书面说明,然后把补发的工资,摊回到以前的工资,再计算应缴纳的个人所得税。
一般的公司如果已经申报纳税后没有发工资属于违法的行为。职工可以向有关部门进行投诉。
公司进行网上报税的流程如下：
（1）登录、核对日期、系统维护、纳税核定，基本信息维护、输入税号、保存退出；
（2）重进软件、系统维护、纳税核定、申报表选择，选择完保存显示到主界面；
（3）数据传输、其他传输、设置通讯参数（只填写注册码，选择互联网），其他传输、字典信息下载、远程下载成功退到主界面；
（4）系统维护、纳税核定、基本信息维护、查看下载信息是否正确。
（5）报表填写增值税、填写各表（增值税附表三和四由系统自动生成），各表填写完毕后一定要保存退出，数据审核，单击“审核”、审核成功，确定返回到主界面；
（6）上网数据传输、数据上报、生成数据、远程上报、提示申报成功，确认返回到主界面；
（7）上网数据传输、数据上报，申报情况反馈信息，查询打印，选择报表打印即可。
法律法规
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十条 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
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