氯代磷酸二乙酯是一种具有潜在危险的化学品。主要侵入途径包括吸入、皮肤接触以及眼睛接触。它作为一种胆碱酯酶抑制剂，短时间暴露可能导致一系列严重后果，如瞳孔收缩、视力模糊、头痛、头晕、肌肉痉挛、乏力、呕吐、腹痛、腹泻等，严重时甚至可能引发癫痫发作、昏迷，吸入后还可能引起心跳减慢。皮肤接触则可能引发心跳加速、胸痛、血压异常和呼吸困难，严重时甚至可能导致瘫痪。一旦皮肤或眼睛接触，应立即用肥皂和水清洗，眼睛则需用温水冲洗15分钟。
在急救处理上，对于吸入者，应立即将患者移至新鲜空气处，必要时进行心肺复苏，如呼吸困难还需提供氧气。若误食，应观察病情，让患者饮水或牛奶，使用盐水或山梨醇促进排泄，并及时就医。
在防护措施上，紧急情况下应佩戴压气式或自吸式呼吸器，全身覆盖防化服，以防止呼吸道和皮肤接触。在火灾情况下，应采用喷水、干粉、二氧化碳或泡沫灭火，并尽可能转移火源，冷却容器以防爆炸。
若发生泄漏，应严禁接触并避免吸入蒸气，消除火源，少量泄漏可用砂土吸附并存放于容器中，大量泄漏则需围堤隔离，处理应在高处和上风向进行。储存时，应将其存放在密闭容器内，保持在凉爽通风的环境中，运输过程中无特殊要求。
氯代磷酸二乙酯是杀虫剂乙基硫环磷（棉安磷）、稻棉磷（地胺磷）的中间体。