中共九江市委统战部作为主管统战工作的核心部门，设有多个职能科室以确保高效运作。以下是其主要机构的职责和职能：
1、办公室
负责对外联络与内部协调，包括机关的文秘、信访、接待工作。部门还负责综合性会议组织、财务后勤以及老干部管理工作。此外，它还承担着统一战线相关课题的研究，撰写重要文件，以及协调民主党派和工商联的宣传事务，参与对外宣传工作。
2、一科（党派科）
主要职责是与各民主党派、无党派人士保持联系，执行党的方针政策。科室内进行关于党领导的多党合作制度和民主党派工作的研究，协助实施民主党派的参政议政和民主监督措施。同时，他们还关注无党派知识分子代表人物，负责大中专院校、医疗卫生和科研机构的统战工作。
3、二科（工商经济联络科）
负责与市工商联（市总商会）的联系，研究非公有制经济代表人物的状况并提供政策建议，同时也负责大中型企业统战工作。此外，科室内还与港澳社团、海外有关团体和台湾有关人士保持联系，以及协调海外统战相关活动。
4、三科（民族宗教科）
主要负责监督我市宗教政策的执行，与少数民族和宗教界代表人物保持沟通，协调重大宗教活动，并协助培养少数民族干部。
5、四科（干部科）
承担党外代表人士的政治安排和领导职务选拔工作，负责党外后备干部队伍建设。此外，还负责统战干部的培训，协调民主党派和工商联的干部管理，以及管理县（市、区）统战部长。同时，管理本部和统战系统相关单位的干部人事事务，并负责党外人士档案资料的收集和管理。
位于九江市长虹大道66号市委大楼七楼的市委统战部，是全市统战工作的核心枢纽。