城市轨道交通系统客流预测方法主要是四阶段预测法。
按照交通生成预测、交通分布预测、交通方式划分预测和交通分配四阶段来分析城市现状和未来的交通状况，是目前交通规划领域应用最广的方法。
一、交通生成预测
预测区域内每一个交通小区的交通出行产生量、交通出行吸引量
目的：获得城市在未来社会经济发展规模、人口规模和土地利用特征下，未来城市各交通小区可能产生和吸引到的总交通量。
二、交通分布预测
解决的问题：每一交通区所产生的出行量到哪个分区去了?它所吸引的出行量又来自哪里?
目的：获得未来城市交通出行在空间上的分布。
三、交通方式划分预测
预测乘客对交通方式的选择问题。
1、根据调查数据，划分现状居民出行方式
2、分析目标年在没有轨道交通方式存在时各种出行方式的OD矩阵
3、预测目标年存在轨道交通时现状各种交通方式向轨道交通转移的比例，从而得到目标年轨道交通的OD矩阵。
四、交通客流分配
目的：预测客流出行方式和交通网络上的流量。
将前一步交通方式划分得到的各个交通小区之间的轨道交通量分配到未来的待选轨道交通路网方案上去，以求路网中各轨道交通线路所承担的客流量。从而得到特定轨道交通路网规划方案的各站点乘降量、断面客流量、站间OD等指标，为确定轨道交通路网规划方案依据。
城市轨道交通的特点
1、运输能力
城市轨道交通由于高密度运转，列车行车时间间隔短，行车速度高，列车编组辆数多而具有较大的运输能力。
2、准时性
城市轨道交通由于在专用行车道上运行，不受其他交通工具干扰，不产生线路堵塞现象并且不受气候影响，是全天候的交通工具，列车能按运行图运行，具有可信赖的准时性。
3、速达性
与常规公共交通相比，城市轨道交通由于运行在专用行车道上，不受其他交通工具干扰，车辆有较高的运行速度，有较高的启、制动加速度，多数采用高站台，列车停站时间短，上下车迅速方便，而且换乘方便，从而可以使乘客较快地到达目的地，缩短了出行时间。
4、舒适性
与常规公共交通相比，城市轨道交通由于运行在不受其他交通工具干扰的线路上，城市轨道车辆具有较好的运行特性，车辆、车站等装有空调、引导装置、自动售票等直接为乘客服务的设备，城市轨道交通具有较好的乘车条件，其舒适性优于公共电车、公共汽车。
5、安全性
城市轨道交通由于运行在专用轨道上，没有平交道口，不受其他交通工具干扰，并且有先进的通讯信号设备，极少发生交通事故。