首先，现在真正懂玄学的人很少了，而能把玄学用到适当之处的人就更少了。一些一知半解的人靠它赚钱，难免就掺杂一些晦涩难懂甚至虚假骗人的东西，造成了不了解真相的人的误解，将其等同于街头算命之流，归于骗术之中。
其次，玄学是一种与科学相对的理论，它回答的很多问题是人类已知的西方科学无法回答的问题。其实玄学也是一门学问，其学术性不能用当代科学的尺度衡量。玄学和科学在问题研究的方法上的存在本质区别，玄学是用纯解释的思路作研究的，科学是用求证的思维作研究的。所以有时会被主流归于封建迷信之中。即使不是直接批判，也不会明确支持，使其处于冷状态，宣讲的少，人们接触了解的就少，所以人们在不了解的状态下相信的就少了。
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