首先，科学并没有证实有灵魂存在，从科学的本质上来讲，科学也不会去证明灵魂到底存不存在，这不是科学的范畴，或者甚至可以说科学概念上根本不存在灵魂这种概念！
有人肯定站出来信心满满地辩解：科学怎么证明灵魂不存在呢？
这种质疑的方式本身就是对科学本质的不理解，认为科学就应该是万能的，就应该能解释万事万物。殊不知科学知识人类了解世界的一种方式而已，而了解世界上方式有很多，比如哲学和神学都是一种方式，你可以用神学解释灵魂，干嘛非要强迫科学去解释灵魂呢？况且科学概念里灵魂这种东西就不存在，这种解释也不一定是正确的，即使不正确，也不能说科学就是错误的，因为科学并不能与正确划等号！
说了这么多，科学到底是什么？
本质上就是一种假设，通过人们对于周围世界的不断观察总结出来一套大自然法则，也就是科学，然后对这种法则不断地进行验证修正！
说白了，人们必须首先观察到某种事物的存在，然后去总结为何而存在，存在的规律是什么（注意这里的观察不仅仅是用眼睛）。同时，科学是一种普遍存在的现象，而不是个案！
说得再直白点，科学研究的不是“灵魂存不存在”的问题，研究的是“灵魂具有什么特性，具有什么规律？”，这就要求必须确定所谓的“灵魂”真的存在，然后用科学研究灵魂的特性，那么如何确定灵魂到底存不存在？如果我们连灵魂存不存在都不知道，就要求科学去解释灵魂，又有什么意义呢？（注意，证实灵魂存不存在，不是科学的范畴！）
所以说，我们必须确定灵魂真的存在（或者不存在），然后再用科学的方式去探索解释灵魂，而确定灵魂存在或者不存在并不是科学需要做的事情，这已经超出了科学的范畴！说点不好听的，你随便想找一个虚无缥缈的概念，就让科学去证明它存在或者不存在，岂不是很没劲？
最后再说一遍，科学只是人们认知了解世界的一种方式而已，它远不是万能的，也不能与正确划等号，所以不要说“科学为何解释不了灵魂？”这样的话，一方面，科学概念里没有灵魂这种定义，至于你相信不相信那是你的选择！科学从来不会强迫某人必须相信科学！另外一方面，科学解释不了的太多了，灵魂又算“老几”呢？