阴阳师聚集在一起而形成的组织称为“阴阳道”。日本的“阴阳道”起源于中国百家争鸣时期的阴阳五行学说。在蒙昧的科学洪荒时代，为了避免灾厄，人们总是希望能预先得知天地变迁的异动，“阴阳五行说”的出现将这一愿望变成了现实。其代表典籍就是自周朝流传至今的《易经》。
话说战国时代，有一支主张提倡阴阳、五行学说的学派称之为「阴阳家」，当时以齐国人邹衍、邹爽为主要代表。「阴阳说」是把「阴」和「阳」看作事物内部的两种互相消长的协调力量，认为它是孕育天地万物的生成法则。这正是老子所说构成世界的概念：「道生一，一生二，二生三，三生万物，万物负阴而抱阳，冲气以为和。」随着世界的复杂多变，当一切事物二分法的简单思考方式，已经无法解释眼前发生的现象。遂衍生出新的思考模式，像「八卦」是用来表示阴阳的移动与变化，代表着各种自然现象，可以用在推算时间的推移、自然的变化以及人生的各种际遇，充满智慧的古人于是将这些现象的诠释整理成「易」，至周朝流传至今的参考典籍就是「易经」。「五行说」则是由金木水火土五种基本物质「不断循环并从而变化」的理论发展出五行相生相克的观念。研究阴阳五行说，能从天体的运行的计算来制订历法，掌握世间万象。到后来，发展出专门研究天体的「天文家」、研究历法的「历数家」以及「五行家」。
公元六世纪，中国的阴阳五行学说混和了道教咒术与密教占术，传入日本。在日本登陆后，又渗透了很多当地文化，于是便形成了独特的“阴阳道”。不过当这个名词正式出现在日本史料上时，已经是十世纪的事了。此时的阴阳道已有别于早期的中国阴阳思想，它兼备了占卜、祭祀、天文、历法等等应用，上至国运皇命，下至庶民之事，都可运用之来解释。推古皇朝的圣德太子就是运用这门知识的佼佼者。笃信佛教的他在制定“冠位十二阶”及服装颜色时都曾考虑到阴阳五行的配合，对日本社会造成了极大影响，从此阴阳师成为热门“职业”，转入全面兴盛时期。 阴阳寮构成:寮头一人 寮助一人 允官一人 大属职一人 小属职一人 阴阳师六人 阴阳博士二人 阴阳生十人 阴阳士一人 皇历博士一人 皇历生十人 天文博士一人 天文生十人 漏刻博士二人 守辰丁二十人 使部二十人 值丁二人。工作内容：1 阴阳道:判断土地凶吉的相地堪舆与占筮. 2 历道：制定日历，决定日子凶吉。 3 天文道:观测天体,卜筮，思考慧星侧隐. 4 漏刻：掌管控制时间。
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