不越狱：
优点：1.省电。
2.系统相对稳定。
3.apple store中下载安装的软件兼容性强。
4. apple store中下载安装的软件（ipa格式）删除后不会留下冗余的系统垃圾文件。
缺点：
1.来电、短信显示归属地，短信回执、flash等系统级软件，在iphone上不越狱是永远无法实现的。
2.系统权限很低。例如，我们不能删掉系统的程序，不能对系统文件和设置进行修改，不能给某个程序加密，不能用蓝牙发送文件，不能用第三方输入法等等……而且第三方软件也不可能实现，为什么呢？应用开发者想在APP商店上架，他们的作品也必须要经过苹果APP Store的认可。
3.只能安装免费程序或者App Store付费下载的软件（中国一般是在淘宝买Gift卡或黑卡、兑换码）。无法装破解的程序（没有账号证书的软件如破解后的.ipa、pxl、deb）。
4.无法更换主题、图标等个性化程序。
5.无法对使用手机直接在浏览器中下载文件，以及对手机的文件进行管理。
越狱：
优点：
1.在原本iOS4.x不越狱时有后台运行功能的基础上，能够使某些不支持后台运行的程序支持后台运行。
2.系统权限很高，可以自己优化系统，可以修改系统文件。可以安装更多拥有高系统权限的软件，实现更多高级功能！例如：与其他设备蓝牙发送文件、短信回执、来电归属地、去电接听震动、文件管理、浏览器下载插件、flash插件、内容管理等等。
3.既能安装免费程序，又可以安装破解、收费的程序。
4.可以更换主题、图标、短信铃声等等，打造个性的手机。
5.可以借助第三方文件管理软件灵活的管理系统或者其他文件。把iphone当移动硬盘（u盘）。
缺点：
1.费电，越狱后系统会常住一些进程保持越狱的状态。视系统级软件（deb格式）安装的数量，某些时候越狱后耗电速度约提升10% ~20%。
2.可能会造成系统不稳定，拥有很高系统权限的同时，我们也伴随着系统崩溃的危险，这个道理大家能理解吧？你可以修改它，但是你不能保证永远正确的修改它。所以系统级的软件宁缺毋滥，不了解用途的情况下不要乱安装。
3.在新的手机固件版本出来的时候，除非你用91手机助手或者小雨伞（tiny umbrella）备份了SHSH，否则千万不要及时的进行更新。因为每个新版本的固件，都会修复上一个版本的越狱漏洞，使越狱失效。而且苹果的iOS固件只能升级，不能降级。因此如果需要保持越狱后的功能，最好要等待新的越狱程序发布的时候，才能正式升级相应的手机固件版本。
4.越狱过程中产生小BUG，但是对正常使用毫不影响.
参考资料：http://baike.baidu.com/view/3194202.htm