区别：
1955年3月1日，中国人民银行发行第二套人民币时首次正式确定人民币的符号。因为人民币单位为“元”，而“元”的汉语拚音是“yuán”，因此，人民币符号就采用“元”字汉语拚音首字母的大写“Y”。
为了防止与“Y”和阿拉伯数字误认、误写，就在“Y”字上加上两横，读音仍为“元”。要注意一横￥是是日元符号，人民币是两横。
日文“円”字即为“圆”之略字（简体字），读为“えん”(en)，并制订1円=100钱=1000厘。
日元货币符号为“￥”，与人民币符号不同（人民币为￥，两横）英语发音为“yen”(读：[jen])。国际标准化组织ISO 4217订定其标准代号为JPY（Japanese yen），而为了区别于人民币，可将日元记作：JPY￥。
符号释疑
一道杠还是两道杠，日元还是人民币
在有些字体（如宋体、楷体、黑体等老字体）中，这个符号的半角表示为“¥”（两杠），全角为“￥”（一杠）；在另一些字体（如微软雅黑）中，全角和半角均是“¥”（两杠）；还有一些英文字体（如Arial，CourierNew）没有全角的“¥”。
拓展资料：
发展历史
1935年，国民党政府对币制进行了改革，将流通货币改为“法币”，一开始，法币只和当时的英镑保持一定的比价，但是随着美国的强大以及美元的强走势，美元在货币中占据了主要作用，因此，法币有同美元挂钩。
而此时，法币符号改为同美元符号一样的“$”。直到1948年，中国人民银行成立，并发行了新中国的第一套人民币，但是人们还是习惯使用 “$”作为人民币的封头符号。直至1955年第二套人民币发行，才正式确定了人民币的符号为“¥”，因为人民币的单位是元，而人民币符号就引用元字的首拼字母Y，同时为了区别与阿拉伯数字的关系，在Y上加上两横，才能使人民币符号变为“¥”，读音仍然为“yuan”。
参考资料来源：百度百科-人民币符号
人民币符号：¥，日元符号：￥（一横）
1955年3月1日，中国人民银行发行第二套人民币时首次正式确定人民币的符号。因为人民币单位为“元”，而“元”的汉语拚音是“yuán”，因此，人民币符号就采用“元”字汉语拚音首字母的大写“Y”。
为了防止与“Y”和阿拉伯数字误认、误写，就在“Y”字上加上两横，读音仍为“元”。要注意一横￥是是日元符号，人民币是两横。
日文“円”字即为“圆”之略字（简体字），读为“えん”(en)，并制订1円=100钱=1000厘。
日元货币符号为“￥”，与人民币符号不同（人民币为￥，两横）英语发音为“yen”(读：[jen])。国际标准化组织ISO 4217订定其标准代号为JPY（Japanese yen），而为了区别于人民币，可将日元记作：JPY￥。
日元：¥。