停薪留职，只是单位的一种行政处分，实际劳动关系依然存在的。
一般正规企业和国企，在公司薪酬制度或管理制度里都有提到停薪留职时员工的薪资如何发放（依照公司制度来发薪酬的），当然不会是没有工资的。
根据《人社部发自关于事业单位工作人员和机关工人受处分工资待遇处理有关问题的通知》，文件规定：“事业单位工作人员受警告处分的，不降低岗位工资、薪级工资和津贴补贴，绩效工资按本单位有关规定发放”。也就是说，仅受到警告处分而不是降低岗位等级或者撤职，工资不受影响。
扩展资料：
《事业单位工作人员处分暂行规定》（中华人民共和国人力资源和社会保障部中华人民共和国监察部令第18号）
第五条处分的种类为：
（一）警告。
（二）记过。
（三）降低岗位等级或者撤职。
（四）开除。
其中，撤职处分适用于行政机关任命的事业单位工作人员。
第六条受处分的期间为：
（一）警告，6个月。
（二）记过，12个月。
（三）降低岗位等级或者撤职，24个月。