农药混合应用时，应留意下列一些难题：
1、凡碰到碱性物质溶解或无效的农药，不可以与偏碱药品混合。如1605、乐果、杀虫双等甲基对硫磷灭虫剂全是带中性化或微酸碱性的农药，在偏碱液中迅速溶解无效。因此这种农药不可以与偏碱的农药混用，也无法与其他碱性物质如氢氧化钠、
石灰粉、香皂、石碱等混用。不然会减少药力，乃至根本无效，并造成药害但敌百虫虽属酸碱性农药，因具备独特物理性质，与一定量的香皂或碱混合同，能迅速转换为触杀功效较强的杀虫双，与此同时药力期减短。杀菌剂中的代森锌、代森铵等遇到强偏碱农药也会溶解无效，因此不可以与氧化乐果、农用链霉素等混用；
2、混合后会发生化学变化能造成药害的农药或化肥，不可以混用。在无机物农药中，普遍到二种或两类之上的农药和化肥混合后，因为相互之间中间发生化学变化而对农作物造成药害。
比如，氧化乐果和农用链霉素混合，转化成多硫化铅。毁坏了农用链霉素和氧化乐果，提升了铜的溶解量，产生比较严重剂量。因此 ，这2种药物不可以混用，乃至不可以持续应用(喷完农用链霉素的功效，必须间隔30天上下才可以再喷氧化乐果)；
3、混合后发生溶剂毁坏状况不但会减少药力，并且易使用物产生药害，也不适合混用。
4.各种各样可湿性粉剂与其他药物及化肥混合后，假如造成絮结很多沉积状况，也会减少药力，并可使农作物造成药害；
5、农药与农药，农药与有机肥的有效混用，对农作物害虫防治蜍物生长发育都是有显著实际效果，但混用一般以2个种类为宜，必需时还可以三个，再多就会造成不良影响，就会增加药量，不仅消耗农药，扩大成本费，并且会加快病原菌、虫害耐药性的产生。与此同时，也很容易造成药害；
6、微生物菌种灭虫剂，微生物菌种杀菌剂，微生物菌种的灭草剂不可以与有机化学杀菌剂农药混用。假如混用，有机化学药物就会杀掉这种微生物菌种药物的微生物菌种而丧尸药力。
农药混配主要是为了更好地省功和提质增效。常见的有灭虫剂与杀菌剂混用，除虫、杀螨剂混用，或杀螨剂与杀菌剂混用，农药、适当的速效性有机肥混用。
因为各种各样农药的物理性质和功能特性不一样，有的农药混用后可具有提质增效功效，有的农药混用后则减效，乃至发生药害因而，农药混用前，务必开展实验。