已经申请了港澳通行证一年一次签注，如果需要过境香港或澳门两次以上，可以在先使用港澳通行证一年一次签注过境，用完签注后再继续申请签注，以便下一次使用。或者，过境前先网上申请签注，并记住签注受理编号，然后再过境香港或澳门，用完签注后，再回去市公安局出入境管理处办理新签注。
第一种：先使用港澳通行证一年一次签注再申请签注。
签注有效期1年1次，不是表示1年内只能去1次，而是指该签注的有效期为1年，在1年以内往返过港澳后，还可以再次申请签注，申请次数没有限制。如果1年内不去，则该签注过期无效，可再次申请。
港澳通行证续签
凭身份证及有效的《往来港澳通行证》办理，也可代办，代办人需携带身份证。（不同城市对续签可能有特殊规定，具体咨询户籍所在地出入境管理处，部分城市可以邮寄续签，电子版港澳通行证可以自行公安局出入境管理处自助机签注，自助缴费办理，无须等待）
【办理时限】自受理之日起7个工作日。
【费用】一次往来签注每个20元；二次往来签注每个40元。并外加签注加注费20元
【特别注意】《往来港澳通行证》有效期不足6个月（部分城市是3个月）的或无足够空白签注页的不能办理，须按首次申请手续办理新的《往来港澳通行证》，同时申请签注。
第二种：可以先提前网上申请续签，记住受理编号，然后再过境香港或澳门，使用完一年一次签注后，回来即可前往市公安局出入境管理处办理签注。
以广东为例
首先登入广东省公安厅出入境服务网站网上申请平台（http://www.gdcrj.com/wsfwdt/wssq/）
然后点击“接受”，接着选择下面的申请类别， 一般我们都是”申请往来港澳个人旅游再次签注(自由行）“
根据表格要求填写相应的信息，在确实无误之后就点击”确定“
是否需要快递：（这里根据个人情况选择，但是建议不选择快递，避免快递来收件时无法过境香港，或过境香港后快递不能正常联系收件）
请前往地区：申请澳门或者香港，可以同时办理
签证种类：请根据自己需要选择（注意 有效期）
签证费用为：20RMB/1次；
最后会显示出申请号，请记住申请受理编号（方便查询），等使用港澳通行证后回来去市公安局出入境管理处办理。
注意：部分地区已经可以自助办理港澳通行证续签，使用电子版卡式港澳通行证可以前往出入境管理处自助服务区里自行办理。参考资料：http://mt.sohu.com/20150810/n418512881.shtml
已经申请了港澳通行证一年一次签注，如果需要过境香港或澳门两次以上，可以在先使用港澳通行证一年一次签注过境，用完签注后再继续申请签注，以便下一次使用。或者，过境前先网上申请签注，并记住签注受理编号，然后再过境香港或澳门，用完签注后，再回去市公安局出入境管理处办理新签注。
《港澳通行证》过期，需要你本人亲自到你户口所在地的县(区)级以上的公安局出入境管理部门办理换证手续，需要携带的资料和相关手续跟第一次办理时是一样的。办理时需要携带以下资料：
你的户口簿原件及复印件。
你的身份证原件及复印件。
复印件为A4规格 。(身份证需要复印正反面，户口簿需要复印户主页，和你所在的那一页)
二寸正面免冠平面彩色近照，蓝色背景，着深色有领上衣，照片大小48X33mm头部宽度21-24mm头部长度28-33mm。(必须在公安局指定的照相馆拍照，也可以在出入境拍照，记得拿照相回执，建议在出入境拍照)
旧的港澳通行证，需要交回出入境管理局。
需要的时间：正常情况下，需要10个工作日 (办理换证，需要经省级部门审批、制证，需要的时间比较长，大概10个工作日，即两个星期的时间)。