截至2017年初，重庆市北碚区有三所（全日制）高等院校（排名不分先后）：
一、西南大学（原西南师范大学与西南农业大学合并而来）
地址：重庆市北碚区朝阳街道天生路2号
西南大学由原教育部直属西南师范大学与原农业部直属西南农业大学于2005年合并而成。原两校毗邻而建，同根同源，均溯源于1906年建立的川东师范学堂，几经传承演变，1936年更名为四川省立教育学院。1950年，四川省立教育学院师范、农学相关系科分别与1940年创办的国立女子师范学院、1946年创办的私立相辉文法学院等合并建立西南师范学院、西南农学院。1985年，两校分别更名为西南师范大学、西南农业大学。此后，重庆轻工业职工大学、四川畜牧兽医学院、中国农业科学院柑桔研究所相继并入
二、重庆师范大学初等教育学院（重庆师范大学北碚校区）
地址：重庆市北碚区团山堡1号
重庆师范大学初等教育学院位于重庆北碚城北新区，距校本部约30分钟车程，依傍在风景秀丽的缙云山下，东临嘉陵江，北接北温泉，南望西南大学。学院占地约170亩，建筑面积7万平方米，绿化率达67%。
三、重庆青年职业技术学院（原重庆青年管理干部学院）
地址：重庆市北碚区歇马镇盐井坝1号
2007年10月，重庆青年职业技术学院整体搬迁至北碚区歇马镇,紧邻北碚国家大学高校园区，占地面积420多亩，新校区一期建设工程投资1.5亿元左右。拥有教学楼、办公楼、多媒体教室、学院局域网、计算机中心、语音室、图书馆、学院网站、标准运动场、学生公寓、学院食堂等。
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