基因工程是人工创造新物种的有效途径，在这个工程中，微生物有着很大的用途。
那么，什么是基因工程呢？我们知道，生物的遗传性都是由遗传物质——基因支配的。基因位于细胞核的染色体中，每个基因都有固定的职能，在个体发育过程中，许许多多基因无比协调地通力合作，才逐渐建立起美丽而对称的生命大厦。
如果我们把一个基因摘下来，从甲生物转移到乙生物，只要处理得当，它将同样能够发挥原有的效应。所谓基因工程，就是根据人类的需要，将某种基因有计划地移植到另一种生物中去的新技术。
科学家发现，微生物可以作为基因的供体，把它的优良性状提供给其他生物；也可以作为基因的载体，把一个生物的优良性状携带给另一个生物，还可以作为基因的受体，接受别的生物的基因，并在细胞内复制和表达。
我们已经知道，微生物具有繁殖快，容易实现工厂化生产等优点，如果把植物或动物的基因移植到微生物中去，就可以多快好省地生产生物制品。