在《南京条约》及其附约中，中国丧失的主权有：领土主权、关税主权、贸易主权、司法主权。
英国人相继取得了协定关税、领事裁判权、划定租界、片面的最惠国待遇（利益均沾）、军舰停泊口岸等特权。这些条约损害中国达百年之久，也便利了资本主义列强的进一步对华侵略。
其中，协定关税、领事裁判权和片面地最惠国待遇更被认为是“束缚半殖民地国家的三条重要链锁”，而对中国来说，它们都是由《南京条约》及其附约首先确定下来的。
扩展资料：
签订《南京条约》，是清朝第一次以主权国家身份，按照双边条约方式，去解决法律冲突和国际争端。
康熙与俄罗斯签订过《尼布楚条约》与《南京条约》作比较，它们其实截然不同。
1、《尼布楚条约》只是一份边界条约，两个帝国以双边条约的方式划定边界，类似于古代会盟，严格来说，它还属于中世纪的地缘政治，我国历代王朝对此并不陌生。而《南京条约》则与边界无关，它主要涉及战争赔款和战后通商等事宜，并由此而建立起基于主权国家的双边关系。
2、《尼布楚条约》是以拉丁文为主，以满文和俄文为辅签订的，这显然与传教士的参与有关。以拉丁文为正式文本，是以尊重教皇仲裁权为前提的，这在西方亦属于中世纪老例，近代民族国家兴起以后，签订条约双方，都以本国文字为主，不再以体现教皇权威的拉丁文文本作为仲裁依据。
基于这两点，真正具有近代意义并以国际法为依据的条约是《南京条约》。
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