区别：
1、上海站是主站，全国各地的火车都有。上海南站是南面的车多，而且多是短途的车。车票上会注明（上海南站）字样。
2、上海站，位于上海市静安区秣陵路303号。上海火车站位于上海闸北区，是上海客流量最大的火车站，也是上海轨道交通的站名。上海市民通常称之为“新客站”，以区别老的上海火车站（即老北站）。上海站主要是去往西和北的列车，既有高铁、动车，又有牵引列车。
上海南站，位于上海市徐汇区沪闵路9001号。主要是南下的列车，兼有往南京等北方城市的列车。每天到发旅客列车33对，无高铁、动车，只有牵引列车。
3、南站是发上海以南地区的车。上海火车站是发往以北的列车。上海和上海南显然不是同一车站，上海南在徐汇区，而上海在闸北区，两站之间有地铁1，3号线连接。
扩展资料
上海站，即上海火车站、上海新客站，位于上海市静安区，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的一座客运特等站，是上海市的第二大火车站，也是京沪铁路、沪昆铁路、沪宁城际铁路的始发枢纽站。上海站毗邻上海长途客运总站，是上海铁路枢纽的重要组成部分。
1908年，伴随着沪宁铁路全线通车，原上海站正式投用；1916年12月更名为上海北站；1947年4月升格为上海总站。1984年9月，新上海站在原上海东站的基础上开建。
1987年12月，新上海站正式启用。 2004年8月，原上海站改建为上海铁路博物馆并开放。2010年，为迎接世博会，上海站进行了整修。
截至2010年5月，上海站站房总面积为9.7万平方米，南广场面积为67000平方米，北广场面积为30000平方米，车场规模达7台15线。
上海南火车站，简称上海南站，旧称上海站，位于上海黄浦区南车站路。南临车站前路，北朝瞿溪路，东跨南车站路，西贴新肇周路。毁于抗战时期的日军轰炸。
在1937年的淞沪会战中，日军战机于8月28日下午轰炸上海南站，运输被迫中断。上海沦陷后，日军又将上海南站至日晖港之间被炸断的长约1.5公里的铁路拆除。上海南站的货运业务迁到日晖港站，旅客运输由上海北站承担。从此，上海南站及站前一段铁路不复存在。
铁路上海南站位于徐汇区西南部，南站主站屋和车站南北广场占地60公顷，东起柳州路，西至老沪闵路，北靠沪闵路，南抵石龙路。南站主站屋设计为巨大圆形钢结构，高47米，圆顶直径200多米，总面积5万多平方米建筑整体结构，气势磅礴。
南来北往的火车可从主体建筑的架空部分穿行而过，意寓"车轮滚滚，与时俱进"。
铁路上海南站是上海中心城市的南大门，也是联系长江、珠江三角洲及我国南方其他城市包括港澳地区的重要交通枢纽。南站及周边地区以其独特的地利条件和投资优势，必将成为与徐家汇城市副中心功能互补的又一区域经济中心。
参考资料：上海站-百度百科
参考资料：上海南火车站-百度百科