《秒速五厘米》主要通过三个篇章来讲述，其中《樱花抄》主要讲述远野贵树与筱原明里过去的事；《宇航员》则讲述澄田花苗的单恋故事，并以她的视角展现转学到种子岛时期的远野贵树；《秒速五厘米》则是讲述了贵树与明里的重逢，但一切已物是人非。
1、《樱花抄》
因为父亲都因工作辗转各地，所以经历相似的远野贵树和筱原明里彼此抱有亲切感，小学时期他们互相依赖、关系亲密，中学进入不同学校后他们不得不通过交换信件联系。
然而最后贵树因父亲调任将转学到偏远的种子岛，于是两人相约见上一面，结果因大雪电车晚点，贵树抵达目的地时已过了约定时间四小时，明里却仍在等着她，在共同度过短暂的一夜后二人分别，之后便失去了联系。
2、《宇航员》
澄田花苗对转学而来的贵树一见倾心，并为他努力学习考上了同一所中学，放学时她常等着有社团活动的贵树，并假装与其偶遇，然后二人一起回家，然而花苗最终没有向贵树告白，因为她意识到贵树有喜欢的人，毕业后她在机场含泪送走了贵树。
3、《秒速五厘米》
回到东京的贵树每天要处理大量工作，内心变得满目疮痍，后来他逐渐失去了对明里刻骨铭心的思念，而明里则嫁为人妇，但他们都没忘记儿时将来一起赏樱的约定，最终在东京樱花盛开的季节，二人在小学常一起经过的铁路道口重逢了。
《秒速五厘米》电影评价
新海诚用电影化的多角度叙事方式，取代了以往一成不变的单线索叙事，用旁人的眼光触及主角远野贵树的感情世界，从第一话到第三话的纵向时间轴将贵树从高中到工作后的变迁串联在一起，时代的变化带动人物性格和生活的变化，将少年时懵懂得让人侧目的爱情和最终一声叹息的不完美结局糅合在一起，显得真切自然，也传递出了新海诚关于影片“距离”的主题。
影片在形式上最突出的地方就在于对细节的描摹：那一种光与影的真实感，积水中树枝的倒影，花瓣落到水面激起的涟漪；画面感极强的声音，安静而空灵的背景音乐；伴着信中含蓄的话语而缓慢切换着的画面，恰到好处的节奏感。
电影由三个独立的部分组成，每个部分讲述了不同的故事，但它们都以时间和距离为主题。故事中的主人公是青梅竹马的两个男女角色，他们相遇、相爱，然后因为种种原因而被迫分开。
第一个部分名为《樱花抄》，讲述了主人公们还是小学生时的故事。他们住在同一个城市，通过写信和游戏机来保持联系。然而，当其中一方搬到离得很远的地方时，两人之间的联系逐渐疏远。
第二个部分名为《宇航员》，讲述了主人公们在中学时代的故事。他们仍然保持着联系，但渐渐地，他们越来越意识到时间和距离的冲击，即使他们相互思念，也无法真正相遇。
第三个部分名为《秒速五厘米》，讲述了主人公们高中时代的故事。尽管分别已久，他们仍然忘不了对方。每天，两人的生活像是在浮沉的梦境中度过，渴望着重新相遇。
整个电影以细腻的画面和优美的音乐为特点，描绘了悲伤的爱情故事以及时间和距离对人们感情产生的影响。它表达了对爱和