规划区内由于降水充沛、水热条件优越，大部分水土流失的地区只要除去人为的干扰，能够在短时间内通过自然恢复植被。在植被覆盖良好、水土流失轻微的典型小流域，应以生态自我修复为主，辅以工程技术措施，着重考虑生态和社会效益。生态修复措施主要包括：封育保护、能源替代、舍饲养畜、生态移民等。
封育保护是恢复林草植被、防治水土流失、改善生态环境的关键措施之一。根据《水土保持综合治理技术规范沟壑治理技术》(GB/T16453.3—2008)标准，对于存在水土流失的疏林地、新植未成林地、灌木林地，实施封禁保护措施。通过这些措施，可以恢复林草植被，提升林草资源效益。项目区的封禁保护措施主要包括：安排管护人员，建立围栏，设置封禁标志，对现有的疏林地进行补植。封育保护措施还涉及：每平方公里安排一名管护人员，在每个小流域封禁区域明显位置每两平方公里设置一个封禁标志，并在适当位置建立围栏，设立禁伐禁牧区，有效阻止人类和牲畜进入，确保封禁措施达到预期效果。同时，对管护人员进行技术培训，提高他们的抚育管理水平，确保封禁保护成果。此外，推广沼气技术，以沼气替代燃料，实施生态移民等措施，减轻人类活动对生态环境的压力，加快封禁区域内植被的恢复速度，改善整个项目区的生态环境。
能源替代是农村可利用的能源之一，包括农作物秸秆、薪柴、煤炭、电能和太阳能。应根据实际情况发展沼气等替代能源，保护现有植被，为生态修复创造条件。据南水北调中线河南水源区调查，每户建设一个8至10立方米沼气池，年均产沼气300立方米，一年可节省柴草2.5吨，相当于0.33公顷薪炭林一年的生长量。使用清洁的沼气能源，能有效解决农村烧柴问题，保护森林资源，改善农业生态环境，实现生态环境的可持续发展。因此，本规划的能源替代措施主要是发展沼气池和省柴灶，主要针对封育保护区内的薪柴为主要生活能源的农户。同时，在规划区内加强封育保护措施，促进人与自然和谐共处。
舍饲养畜是改变传统生产方式的重要内容之一，要解决好水源区牲畜的安置问题。根据项目区的养畜习惯和畜群结构调整方向，结合规划的养畜规模，采取集体或个体方式统一建设畜舍。畜舍主要建在封育保护和项目区内有散养牲畜习惯的自然村。以小流域为单元，建设小流域水土保持治理措施标准体系，对水源地水源涵养、保持良好水质、保持和改善生态环境、促进区域经济社会发展、确保南水北调工程效益的充分发挥具有重要意义。然而，小流域水土保持治理工程是一项涉及广泛、长期而复杂的系统工程。因此，为确保规划目标的实现，规划区各县市必须加强领导和组织协调；制定并完善水源地保护法规，严格制度建设；加强项目建设的协调和运行管理；加强执法部门的执法监督；提高科技支撑能力，做好技术培训；依托省级水土保持监测部门进行生态监测等多项规划保障措施，以确保小流域防治措施治理效益的发挥和治理目标的实现。
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