不经处理的城市生活污水，造纸污水，农业污水，都市生活垃圾危害：消耗水中溶解的氧气，危及鱼类的生存。导致河流和溪流发黑，变臭，毒素积累，伤害人畜。
大多数洗涤灵都是石油化工的产品，难以降解，排入河中不仅会严重污染水体，而且会积累在水产物中，人吃后会出现中毒现象。
含磷洗衣粉会引起水中藻类疯长，人类排放的含磷污水进入湖泊之后，会使湖中的藻类获得丰富的营养而急剧增长(称为水体富营养化)。
土壤流失，向河流倾倒垃圾造成降低水的质量，增加净化水的难度和成本。 现代生活垃圾有许多难以降解的成分，如塑料类包装材料。它们进入河流之后，不仅对水中生物十分有害(误食后致死)，而且会阻塞河道。
一些有机化学药品会积累在水生生物体内，致使人食用后中毒。 绝大部分有机化学药品都有一定的毒性，它们进入江河湖泊会毒害或毒死水中生物，引起生态环境破坏。 被有机化学药品污染的水难以得到净化，人类的饮水安全和健康受到威胁。
采矿和冶炼过程，工业成产的废弃物，制革废水，纺织厂废水，生活垃圾(如电池，化状品)会对人、畜有直接的生理毒性。 用含有重金属的水来灌溉庄稼，可使作物受到重金属污染，致使农产品有毒性。沉积在河底，海湾，通过水生植物进入食物链，经鱼类等水产品进入人体。
海洋上油船的泄漏会造成大批海洋动物(从鱼虾，海鸟至海豹，海狮等)死亡。水上机动交通运输工具，油船泄漏造成的危害：会破坏水生生物的生态环境，使渔业减产。 污染水产食品，危及人的健康。
煤矿，其它金属(铜，铅，锌等)矿山废弃物，向河流中排放酸的工厂，会毒害水中的绿色植物引起鱼类和其它水中生物死亡。 严重破坏溪流，池塘和湖泊的生态系统。