高性能计算机集群系统是一个是基于网络、面向科研的小型高性能并行计算系统，该系统通过一组松散集成的计算机软件和硬件高度紧密地协作完成计算工作。通过局域网连接集群系统中的单个计算机节点，使之同时完成同一个工作，以达到高工作效率、高计算速度和高可靠性能。
该系统的基础是主控节点、计算节点等硬件基础平台和互联系统，系统分层次设计，按照Intel的高性能计算生态系统部署，自上而下，按照“HPC并行应用程序→中间件集群管理和通信库以及各类软件优化工具→操作系统→计算节点和主控节点的硬件平台→系统环境”的部署进行设计，包括散热、电源、空间布局等规范化的设计。