许多植物的地下构造本质上为特化的茎（如球茎、块茎），但是根与茎是不同的，根与茎不同处主要在于缺少叶痕与芽，具有根冠，分枝由内部组织产生而非由芽形成。根与茎的主要区别有：
一、定义不同：
1、根一般指植物在地下的部位。
2、茎是植物体中轴部分。
二、作用不同：
1、根负责吸收土壤里面的水分及溶解其中的无机盐，并且具有支持、繁殖、贮存合成有机物质的作用。
2、茎具有输导营养物质和水分以及支持叶、花和果实在一定空间的作用。有的茎还具有光合作用、贮藏营养物质和繁殖的功能。
三、结构不同：
1、根分为根尖结构、初生结构和次生结构三部分。
2、而茎分为初生结构、次生结构和横切面。
四、分类不同：
1、根分为直根系、须根系、不定根和假根。
当种子萌发时，胚根发育成幼根突破种皮，与地面垂直向下生长为主根。当主根生长到一定程度时，从其内部生出许多支根，称侧根。除了主根和侧根外，在茎、叶或老根上生出的根，叫做不定根。反复多次分支，形成整个植物的根系。
直根系的主要特点是主根明显比侧根粗而长，从主根上生出侧根，主次分明；须根系的主要特点是主根和侧根无明显区别 。
2、茎分直立茎、缠绕茎、攀援茎、斜升茎、斜倚茎、平卧茎、匍匐茎等。
茎干垂直地面向上直立生长的称直立茎。大多数植物的茎是直立茎，在具有直立茎的植物中，可以是草质茎，也可以是木质茎，如向日葵就是草质直立茎，而榆树则是木质直立茎。
缠绕茎细长而柔软，不能直立，必须依靠其他物体才能向上生长，但它不具有特殊的攀援结构，而是以茎的本身缠绕于它物上。
缠绕茎的缠绕方向在每一种植物中是固定的，有些是向左旋转（即反时针方向）如牵牛、茑萝；有些是向右旋转（即顺时针方向）如金银花；也有些植物的缠绕方向可左可右，如何首乌。
攀援茎细长柔软，不能直立，唯有依赖其他物体作为支柱，以特有的结构攀援其上才能生长。有缠绕茎和攀援茎的植物统称藤本植物。热带亚热带森林里藤本植物特别茂盛，形成森林内的特有景观。
五、其它方面：
根还有多种经济用途，它可以食用、药用和做工业原料。
甘薯、木薯、胡萝卜、萝卜、甜菜等皆可食用，部分可作饲料。人参、大黄、当归、甘草、柴胡、龙胆等可供药用。甜菜可作制糖原料，甘薯可制淀粉和酒精。某些禾本科或藤本植物的老根，可雕制成工艺美术品。在自然界，根有保护坡地、堤岸和涵养水源、防止水土流失的作用。
多年生木本植物茎内，次生木质部占的体积最大，即为木材。木材为建筑、采矿、交通运输以及日常生活（如家具、柴炭）所不可缺少。此外木材可以造纸和提炼各种化工产品，如松节油、松香、酒精，活性炭和醋酸等。
茎的外围部分(即韧皮部)可为纤维的来源。用于造纸、纺织等，有的由树皮中的分泌结构可产生经济价值很高的物质，如橡胶、漆、杜仲胶等为工业原料或医药药材。一些变态茎，如马铃薯、葱、姜、蒜等为食用或调味品。
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