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1937年，原由中央组织部调查科扩编成的特工总部，与力行社特务处合并，成立国民政府军事委员会调查统计局。由陈立夫、陈焯任正、副局长。特工总部编为该局第一处，处长徐恩曾。合并后矛盾逐渐激化，一九三八年八月又分开，将第一处改为国民党中央执行委员会调查统计局 (简称中统局)。
中统局，先后由陈立夫、张厉生、朱家骅先后担任过局长，徐恩曾、叶秀峰、顾建中，邹学峻、季源溥等先后担任过副局长。但主要是徐恩曾主事。徐1945年因戴笠告密走私，被撤职。
1947年中统改称党通局，49年划归内政部称内调局，54年又改组为司法行政部调查局
军统
46年戴笠死后进行改组，其公开特务武装部分与军委会军令部二厅合并为国防部第二厅，由郑介民任厅长；秘密核心部分组成国防部保密局，毛人凤为局长。
１９５５年，情报机构改制。保密局改组为国防部情报局。保防侦查等业务拨归“司法行政部调查局”接管。一般说来，该阶段先后实际执行者为毛人凤与蒋经国。
１９８４年发生江南案，当时之情报局长汪希苓亦被捕入狱，情报局再次大改组。１９８５年７月１日，情报局与国防部特种情报室并编成立军事情报局，隶属国防部参谋本部，受参谋总长直接指挥
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