沼气池建好使用一段时间后，由于发酵、温度、水份及酸碱度的共同影响，在池内的沼液上层逐渐形成一致密层，影响沼气的生成与沼气通过，为此，防止沼气池内沼液沼渣结壳的办法： 一、经常搅拌沼液。（1）液体搅拌。每隔两天从出料间掏出数桶发酵液，再从进料口将此发酵液冲到池内。（2）器具搅拌。从进料口或出料口慢慢伸入池中，用力来回拉动几次，每天定时搅拌一次，每次五分钟。简易搅拌器的制作方法：用一根长2米的木棒，一端固定一个直径为18~19厘米的圆木板，木板边缘用4根木条与主轴固定。（3）经常调节水量，保持沼气池内发酵原料适宜的浓度。若发酵间内含水量过少，发酵液太浓，容易积累大量有机酸，发酵原料的上层易结壳。 二、在冬季产气低的情况下让沼气池停止运行一周。在停止运行前，用完沼气池内所产的沼气，打开总开关，关闭调控器开关，把集水器中的软管从水中拔出，继续向池中加水，使沼气池处于满装料状态，让沼气池停止运行一周，这样使沼气池上层的浮渣浸泡在溶液中，过几天形成沉渣，达到防止结壳的目的。
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