中国人民解放军第一军医大学的学科建设多元且实力雄厚，涵盖了医学、理学、工学、文学、管理学、法学和经济学等7大领域，为学生提供了广泛的学习选择。
在博士学位的授予上，该校拥有6个一级学科的博士学位授权，包括临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、中药学以及生物医学工程。此外，还有4个博士后科研流动站，涵盖了基础医学、临床医学、生物医学工程和预防医学等多个领域，为研究学者提供了深入研究的平台。学校共计设有53个博士学位授权点和65个硕士学位授权点，为学生的学术发展提供了坚实的基础。
在学科优势上，一军大拥有3个国家重点学科，分别是人体解剖与组织胚胎学、内科学（消化系病）和中西医结合临床。同时，还拥有3个国家中医药重点学科，包括中医内科肾病学、中药制剂学和中医内科脑病学，体现了其在中医药领域的领先地位。
在省级层面，学校有10个广东省重点学科，涵盖了多个学科方向。此外，还拥有教育部工程研究中心、省部共建重点实验室以及12个广东省重点实验室和3个广东省教育厅重点实验室，进一步突显了其在学科研究上的卓越表现。国家重点学科分布在3个一级学科中，而省级重点学科则广泛覆盖了24个二级和三级学科，显示了其学科体系的全面性和深度。
中国人民解放军第一军医大学是南方医科大学的前身，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年被批准为全国8所试办八年制医学教育的高等院校之一，2004年8月按照国务院、中央军委下达的命令，整体移交广东省，更名为南方医科大学。现有校本部、南校区、顺德校区等3个校区，占地面积176.68万平方米，建筑面积85.41万平方米。面向全国31个省、自治区、直辖市及港澳地区招生。