目前为止比较被认同的是苏联的防空雷达确认飞机在堪察加半岛东北飞行，当时判定为当晚刚好在当地执行间谍任务的美军RC-135型电子侦察机，然后苏联空军的Su-15战斗机找到KAL007，但因为天色昏暗，无法认出机型，苏联空军的战斗机实施威吓射击，因没有装备曳光弹，所以只发射了彻甲弹，客机没有做出任何反应，KAL007拉高飞行高度到达35,000呎，速度变慢，苏联战斗机被迫改变高度以免两机相撞，苏联飞行员将此解释为战争行为，认为敌机打算逃脱，因为该客机即将飞出苏联领空，遂下令开火将其击落。
当然也有一些其他的说法：
1、导航装置设定失误说：波音747的航道事前可先输入设定，让电脑自动驾驶，除非是遇到恶劣天候及起飞降落阶段才由手动驾驶，推测是正副机师操作错误导致飞机偏离预定航道。有下列几点可能原因：导航装置的机械故障INS（仪器导航系统）输入失误惯性导航装置的起动失误惯性导航装置的切换失误。但是，正驾驶、副驾驶、飞航工程师三人操纵飞机，若是有设定或输入方面的错误，应该要能立刻发觉。且民航机的航行灯号是很容易识别的，但苏联空军却没有辨认出来而直接击落。
2、美军指示说：美军与韩国有同盟关系，想要了解苏联在远东地区的战斗机部署状况，因此指示韩航的民航机故意飞入苏联领空刺探，此说法被当成阴谋论而普遍被拒绝。此说法有下列几点根据：KAL007在苏联领空附近的航迹为不自然蛇行。机长为空军退役军人（韩航许多机师担任过空军军人）。苏联领空边缘常有美军的RC-135侦察机飞行，且因为在夜间，苏联战斗机的驾驶员忽略了民航机的航行灯误以为是美军的侦察机。不过，如果KAL007真的是奉美军的指示以民航机从事间谍飞行的话，应该会尽量伪装及隐藏自己的航迹，但是在通过报告点时所报告的气温却比正常航道来得低。且美军若真的利用搭载数百名无辜旅客的无武装民航机进行间谍任务的话，根本不可能掩得住相关人士之口。而根据俄国归还的黑盒子中的座舱通话记录，也未显示驾驶有任何执行秘密任务的对话。
3、节省燃料说：机长想要节省燃料，因此就偏北飞行以求缩短航程。当时韩航的运费很便宜，因此节省燃料帮公司降低成本成了机长的使命。但是，为了节省燃料而冒险飞进苏联领空是否有必要；且苏联空军飞行员应看得到KAL007的民航机航行灯，纵使看不到机身，也不应冒着被国际指责而轻易击落。不过根据13年后与当年击落客机的苏军飞行员的访谈确认，当时苏军飞行员从机侧两列窗户的特征知道这是一架波音制的飞机，不过他认为这并不代表任何意义，因为一架民航机只要经过改装即可从事军事任务。
4、航班遭扣押说：关于此次空难的研究专著《搜救007：大韩航空007号班机及其幸存者》于2000年出版。在书中，作者指出航班KAL007在遭受空对空导弹袭击后，并未立即爆炸，而是继续飞行了大约12分钟，最后成功的迫降在库页岛或者邻近海域。根据1993年对苏联政府交出的飞机的黑匣子数据的分析，认为Su-15战斗机发射的两颗空对空导弹的其中一颗，即采用热制导方式的那一颗并未命中目标。因为黑匣子内记录了导弹命中后机长与机械师的一段对话。对话中机长询问情况，机械师回答引擎运转正常，由此判断热制导导弹没有命中飞机引擎。这使得飞机有机会迫降。同时根据俄罗斯政府在1992年解密的关于此次事件绝密资料中，作者注意到当时指挥官在导弹命中后，询问为什么那架飞机仍然在飞行之类的抱怨话语。至于那些幸存者之后的事件，作者根据来自一个名叫“苏联监狱、精神病监狱及强制劳改集中营研究中心”的组织的资料，作者指出是苏联政府扣押了全部的乘客以及机组人员，并拒绝对外界承认此事。当局扣押乘客以及机组人员至今。我个人认为这个最不靠谱，但是也最有可能。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考