元明以来，凡江海河滨，莫不有天后宫、天妃庙等名号的祭祀建筑，享受广大信众香火供奉的是一位端庄慈祥的女神，俗称"妈祖"或"海神娘娘"。据专家考证，妈祖本为福建莆田、仙游地区的民间信仰，其后才因历朝封建政府不断封赐等缘故，逐渐成为全国性的正神。俗信妈祖不仅能保佑航渡江海人的平安，并且兼有消灾解厄、赐福送子等多种神通。随着明清时期民间贸易和移民活动的发展，妈祖信仰也传播到海外更遥远的地方，受到全世界华侨华裔的敬仰。1987年夏历九月初九（公历10月31日），会集莆田湄州岛妈祖庙的港台同胞、海外侨胞及来自大陆各地的男女信众达十万之多，举行了纪念妈祖逝世一千周年的隆重祭典，还召开了学术讨论会。在此前后，台湾海峡两岸都掀起了研究妈祖的热流，各种资料、图册和研究成果纷纷推出。但是，在有关妈祖信仰的不少问题上，仍是众说纷纭，比如妈祖的身世之谜，就是其中之一。
一般说法，妈祖姓林，名默，是五代后周都巡检林愿的小女儿，生于北宋太祖建隆元年(960)夏历三月二十三日。她自幼聪敏，能为人治病，水性也好，有"龙女"之称。当时常有渔船商轮在其故乡湄洲屿前遇风倾覆，或困于礁丛，妈祖逢难即救，成活渔民客商无数。宋太宗雍熙四年(987)九月初九，时年二十八岁的她突然辞别家人，在湄洲屿最高处升天而去。其后，她屡屡在波涛汹涌的大海上显灵，为泛舟人保驾护航。宋徽宗宣和五年(1123)，给事中路允迪出使高丽，在海上遇险，得到妈祖显灵相助，方得转危为安。上奏朝廷后，徽宗特赐"顺济"，立庙奉祀。此后，历代王朝不断对她加爵褒封，其中尤以元朝至元十五年(1278)加封的"护国明著灵惠协正善庆显济天妃"最为显赫，所以除闽台一带民众仍亲切地称其为"妈祖"外，天下人都尊为"天妃"或"天后"。清赵翼《陔余丛考》记："江汉间操舟者，率奉天妃，而海上尤甚。……相传大海中，当风浪危急时，号呼求救，往往有红灯或神鸟来，辄得免，皆妃之灵也。"妈祖信仰之影响深远，由此可见。
但是，上述关于妈祖的履历，自明清以来，不断受到学人的质疑。如有人指出，路允迪出使朝鲜赖海神济助才得转危为安的故事，在《八闽通志》上就有记载，而该书谓"神"乃唐末观察使陈岩长子，是五代时已经流行连江演屿的地方神奉祀，因知妈祖救路而得徽宗赐额云云，当是民间故事流传中的"嫁接"。还有人指出，现在湄洲所传之妈祖族谱上所列其祖、父所任官职如"福建总管"、"都巡检"等等，皆不存在于五代各国官制中，显然是后人所加的。
在妈祖信仰日益隆盛的情形下，佛家和道家也对其身世作出了各自的解释。如元黄仲元《圣墩顺济祖庙新建蕃厘殿记》称，妈祖是"普陀大士之千亿化身"。明代出版的《三教源流搜神大全》，对此叙述更详：妈祖母亲陈氏尝梦南海观音"与以优钵花，吞之，已而孕"，十四个月后生下妈祖，时在唐天宝元年(742)三月二十三日。因是观音化身，所以她在襁褓中就能礼佛，五岁便会诵《观音经》，长成后慈悲为怀，普救众生。道家则称妈祖之前身乃妙行玉女，因太上老君目睹"舟船往复，风水不便……其诸鬼神，乘此阴阳变化，翻覆舟船，损人性命"，故命她"降生人间，救民疾苦"(《太上老君说天妃救苦灵验经》)。据《宋会要》，宋时莆田县有张天师祠，当地民众在祠内附祀"宁海镇顺济女神庙灵惠夫人"，似乎也为妈祖信仰源于道教提供了证据。
有人认为妈祖未必实有其人，而是民间在幻想中虚拟的海神。宋代以来，莆田一带的航海十分发达，面对波涛汹涌的大海，人们难以摆脱恐惧心理，便企望有一尊拯世护航的神灵保佑，妈祖信仰由此发轫。至于天妃、妈祖之女性形象及其名称的由来，清人赵翼解释道：按阴阳学说，天为阳，地为阴，水在地上亦为阴，男属阳，女属阴，故水神之象应为女性；地媪与天帝相配称"天后"，水母次之，故称"天妃"；"妈祖"者，则是闽人未嫁女子在娘家的称谓。故"天妃之名，即谓水神之本号可，林氏女之说，不必泥也"(《陔余丛考》卷三五)。此说颇为一部分近代学者赞同。
又有人认为妈祖信仰乃巫觋文化的产物，根据是莆田地方史志对其人其事的追述资料。如南宋廖鹏飞说她"初以巫祝为事，能预知人祸福"(《圣墩祖庙重建顺济庙记》)；黄四如说她"湄洲屿人，初以巫祝助事，能预知人祸福，既殁，众为立庙"(《圣墩顺济祖庙新建蕃厘殿记》)，南宋绍熙年间的《莆阳志》也说她原为"里中巫"。种种材料都说明她生前是一位在湄洲屿一带活动的能"预知人祸福"的妇女。北宋时民间迷信盛行，地方上出一二个巫祝并不奇怪。如果该巫祝具有一点今天所说的"特异功能"的话，则更见其神异。妈祖似乎就是一个有点特异功能的人，民间流传的种种诸如"伏机救亲"、"收伏二怪"、"保护册使"的奇异传说，更增添了她的神奇色彩。在其由人到神的嬗变过程中，普通民众祈求平安的善良愿望和统治当局的附会利用都起了相当的作用。政治原因和社会心理的双重合奏促使了这次造神活动的成功。
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