深圳市的交通运输管理机构包括多个派出单位，以确保城市交通的高效运行。在西部，设有深圳市交通运输委员会西部交通运输局，负责该区域的交通规划和管理。而在东部，有深圳市交通运输委员会东部交通运输局，他们致力于东部地区的交通设施建设和维护。
宝安和龙岗两区的交通事务分别由深圳市交通运输委员会宝安交通运输局和深圳市交通运输委员会龙岗交通运输局处理，这些机构专注于各自区域的交通服务和安全。光明和坪山则分别设有深圳市交通运输委员会光明交通运输局和深圳市交通运输委员会坪山交通运输局，他们关注的是这两个新兴区域的交通发展与创新。
深圳市的客运交通管理工作由市交通运输委员会客运交通管理局负责，同时，这个机构也承担着市小汽车定编办公室的职责，对于车辆管理和城市交通秩序起着重要作用。而深圳市交通运输应急指挥中心更是核心部门，它既是深圳市交通战备办公室，也与深圳市交通运输委员会港航和货运交通管理局紧密合作，共同应对各类交通应急事件和货物运输管理。
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