《阿凡达2》延续了第一部的剧情，男主杰克变成了拥有地球基因的那威人。由于奥马蒂卡亚部落的少族长战死，男主顺利接班，并与女主奈蒂莉喜结良缘。婚后，男主家生育了三个混血儿，领养了一个女儿，一家人其乐融融。
好巧不巧，跟男主一家非常亲近的，人类遗留在潘多拉星球的孩子“蜘蛛”，正是第一部大BOSS迈尔斯上校的孩子。男主杰克率领部族以“敌后武工队”的形式，趴火车，搞机枪，四处埋伏，把四处扩张的“天空人”搞得魂飞胆丧。在阿凡达人民的麻雀战、游击战之下，奥马蒂卡亚部落收拢了许多人类战俘，鸟枪换炮，科技树直接点满。
为了消灭男主杰克这个心腹大患，基地的女将军决定实施“斩首行动”。她从地球征召了一批“伪·阿凡达”，也就是第一部的大反派迈尔斯·库里奇上校。这一次他不但保留了前世的作战经验和记忆，甚至拥有了蓝色阿凡达躯体。
迈尔斯披着阿凡达的羊皮，自然不会被女神“埃娃”排斥。这支“夜袭队”渗透到哈利路亚山附近，直接俘获男主的几个孩子。在男主两口子的主角光环下，完成了一波反杀，成功地救回了自己的孩子。巧合的是，迈尔斯上校也救回了自己的人类孩子。
作为詹姆斯·卡梅隆导演率团队耗时十三年精心打造的超级3D视效大片，《阿凡达2》真实感极强的视觉特效呈现，令人叹为观止的丰富想象力，无疑是吸引观众的最大看点。
片中的潘多拉星球，不仅有第一部中的奇幻深林、奇山异石、奇珍异兽以及长相奇特的纳美人，更有瑰丽惊险的海底世界，神奇无比的海洋生物，硕大无朋的图鲲，还有长翅膀的海蛇，乖乖地成为岛礁纳美人畅游海洋的坐骑。
无论是潘多拉星球上的森林还是海洋，山地还是岛礁，人与动物的表情还是动作，肌肤还是毛发，都惟妙惟肖、纤毫毕现，给人以身临其境、近在眼前的强烈真实感。
影片临近结尾，迈尔斯·夸里奇上校率地球人对海洋中的图鲲大开杀戒，并绑架了杰克的孩子作为人质，杰克夫妇在岛礁纳美人的帮助下，与之展开殊死搏斗，场面格外激烈精彩。