一、分类不同
1、真菌：最常见的真菌是各类蕈类，另外真菌也包括霉菌和酵母。
2、原生生物：可分为三大类，藻类、原生动物类、原生菌类。
二、特点不同
1、真菌：真菌的细胞有含甲壳素（又叫几丁质、甲壳素、壳多糖）为主要成分的细胞壁，和植物的细胞壁主要是由纤维素组成的不同。
2、原生生物：原生生物包括简单的真核生物(即具有真正的细胞核，以核膜为界限的细胞核)，多为单细胞生物，亦有部分是多细胞的，但不具组织分化。这个界别是真核生物中最低等的。
扩展资料：
真菌基本特点
1、直接作用于菌体细胞
抗生素则能选择性地作用于菌体细胞DNA、 RNA和蛋白质合成系统的特定环节，干扰细胞的代谢作用，妨碍生命活动或使停止生长，甚至死亡。而不同于无选择性的普通消毒剂或杀菌剂。
2、具有选择性
抗生素的作用具有选择性，不同抗生素对不同病原菌的作用不一样。对某种抗生素敏感的病原菌种类称为该抗生素的抗生谱（抗菌谱）。
3、有效作用浓度
抗生素是一种生理活性物质。各种抗生素一般都在很低浓度下对病原菌就发生作用，这是抗生素区别于其他化学杀菌剂的又一主要特点。各种抗生素对不同微生物的有效浓度各异，通常以抑制微生物生长的最低浓度作为抗生素的抗菌强度，简称有效浓度。有效浓度越低，表明抗菌作用越强。
参考资料来源：百度百科-真菌
参考资料来源：百度百科-原生生物
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