哈利在德思礼的家里焦急地等待着校长的来访，邓布利多带他到一个神秘的地方，告诉了他和哈瑞斯制服伏地魔的方法。在魔法学校，哈利、罗恩和赫敏继续着他们三人小组的学习，时时相互鼓励和玩笑；斯内普教授仍时不时找哈利的麻烦。
在一次课上，哈利和赫敏无意中发现了一本奇怪的小书，书上标注着“本书为混血王子的财产”。这本名为《高阶药剂工艺》的书，每一页上都有混血王子详细的手写注释。繁重的功课让哈利没有时间来研究此书，但在关键时刻这本书总能带给他好运。一天，斯内普让他去参加一节课，这节课让他想到了《高阶药剂工艺》一书与混血王子的关系……
圣诞节后，罗恩度过了一个并不愉快、但却十分新奇的生日。这时，伏地魔出现了，这次他竟然杀死了海格的宠物阿拉格格，小伙伴们为这只蜘蛛举办了盛大的葬礼。
邓布利多终于发现斯内普已受到伏地魔的控制，并告诉哈利，要他设法保护每一个斯内普不喜欢的孩子。为对付伏地魔并解救孩子，邓布利多与哈利意外地来到一个古洞中。就是在这个洞中，邓布利多深受重伤。正在此时，斯内普突然出现，竟用魔杖将校长化为灰烬。目睹这一切的哈利，在伙伴的帮助下，杀死了斯内普。斯内普临死时吼出了自己就是混血王子的惊天秘密。
在邓布利多的墓前，哈利和他的伙伴们给了校长最高的敬意。伏地魔很快就要出现，只有除掉伏地魔，哈利和他的伙伴们才能真正地一起快乐生活。
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