1、学校地址不同
绵阳南山中学位于四川省绵阳市涪城区南塔路3号。
南山中学实验学校位于四川省绵阳市涪城区教育园区。
2、学校现任校长不同
绵阳南山中学现任校长为唐江林。
南山中学实验学校现任校长为谭世贵。
3、建校时间不同
绵阳南山中学创办时间为1908年。
南山中学实验学校创办时间为2011年。
四川省绵阳南山中学（Mianyang Nanshan High School）简称南山中学，地处中国科技城──绵阳市，是四川省首批重点中学、首批“国家级示范性普通高中”、首批“四川省一级示范高中”，先后入选全国高校自主招生百强学校、全国拔尖创新人才培养基地。
中国高中教育50强校、全国“三八”红旗先进集体、全国“十佳”巾帼文明岗、“全国基础教育发展成就30校”、全国50所“百年名校”、全国师德建设示范单位、全国心理健康教育示范学校、全国体育卫生先进单位。
中国大陆260所最佳高中第38位、“世界名中学联盟”成员，被清华大学、北京大学、浙江大学、复旦大学等众多著名高校确定为“优质生源基地”。
南山中学实验学校坐落于美丽的中国科技城——四川省绵阳市，是绵阳市委市政府站在进一步促进绵阳教育优质发展战略高度，于2010年创办的市直属、高起点、高规格、新机制全员寄宿制优质高中学校。学校与百年名校南山中学一脉相承。传承百年南山的名校品质，铸就新锐南实的非凡品味。
参考资料来源：百度百科-四川省绵阳南山中学
参考资料来源：百度百科-南山中学实验学校
绵阳南山中学与南山中学实验学校的区别如下：
从学校体制来说：
绵阳南山中学属于公立高中，南山中学实验学校属于私立高中。
从两者的关系来说：
绵阳南山中学实验学校属于绵阳南山中学的附属兄弟学校。因为绵阳南山中学实验学校得到了绵阳南山中学的投资。
从两者的见效时间来说：
绵阳南山中学实验学校2011年建立，时间甚短。绵阳南山中学1908年创办，比绵阳南山中学实验学校早了100多年。