不会作废，需重新考核。
根据《医师执业注册管理办法》：
第十二条 申请医师执业注册，应当提交下列材料：
（一）医师执业注册申请审核表；
（二）近6个月2寸白底免冠正面半身照片；
（三）医疗、预防、保健机构的聘用证明；
（四）省级以上卫生计生行政部门规定的其他材料。
获得医师资格后二年内未注册者、中止医师执业活动二年以上或者本办法第六条规定不予注册的情形消失的医师申请注册时，还应当提交在省级以上卫生计生行政部门指定的机构接受连续6个月以上的培训，并经考核合格的证明。
扩展资料：
依据《中华人民共和国执业医师法》相关规定，内容如下：
第九条 具有下列条件之一的，可以参加执业医师资格考试：
（一）具有高等学校医学专业本科以上学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的；
（二）取得执业助理医师执业证书后，具有高等学校医学专科学历，在医疗、预防、保健机构中工作满二年；具有中等专业学校医学专业学历，在医疗、预防、保健机构中工作满五年的。
医师资格考试报名资格规定：
十五、具有下列情形之一的，不予受理医师资格考试报名：
1、卫生职业高中毕业生；
2、基础医学类、法医学类、护理学类、辅助医疗类、医学技术类等相关医学类和药学类、医学管理类毕业生；
3、医学专业毕业，但教学大纲和专业培养方向或毕业证书注明为非医学方向的；
4、医学专业毕业，但教学大纲和专业培养方向或学位证书证明学位是非医学的；
5、非现役军人持军队医疗、预防、保健机构出具的试用期证明报考或在军队报名参加医师资格考试的；
6、现役军人持地方医疗、预防、保健机构出具的试用期证明报告的；
7、持《专业证书》或《学业证书》报名参加医师资格考试的；
8、1999年1月1日以后入学的卫生职工中等专业学校的学生毕业后报考执业助理医师资格考试的。
参考资料来源：百度百科-医师执业注册管理办法
执业医师证书是永久有效，不会作废的，但要在两年内进行注册。
《医师执业注册暂行办法》第七条规定，获得执业医师资格或执业助理医师资格后二年内未注册者，申请注册时，还应提交在省级以上卫生行政部门指定的机构接受3至6个月的培训，并经考核合格的证明。
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既然考了证，就应该及时注册，哪怕注册到当地一个小诊所也行（也有很多小诊所由于没执业医师，所以还花重金聘证）。
只要注册了，卫生局哪管你今天、明天有没有在诊所上班？
如果没证，博士后毕业了也得考执业医师证（假如你要从医的话）。本回答被提问者采纳