重庆主城区放在长江与嘉陵江的结合部，是历史的选择。
四川过去称为巴蜀，但只限于1997年之前。1997年之后再称四川为巴蜀就不合适了，因为古称为巴的重庆不再隶属四川了。古人经常提到的“巴”，其实指的就是重庆（以下皆指重庆主城区）。
重庆之所以成为巴国国都、巴郡治所，这和重庆特殊的地理位置是分不开的。重庆位于长江上游与嘉陵江的汇合处，四川盆地的东部。重庆的长江东岸不远就是山地，再往东就是贵州省与重庆市边界的大娄山。
嘉陵江是长江上游的重要支流，发源于陕西省宝鸡市凤县的嘉陵谷，穿陕西省汉中市，四川省广元市、南充市、广安市进入重庆市。嘉陵江流淌在四川盆地，会合了涪江、渠江等大型河流，土地肥沃，人口稠密。
两汉时的蜀中有两大郡，西有蜀郡成都，东有巴郡重庆。两郡有很多共同点，只说两个：一、都位于人称天府之国的四川盆地，二、都临大河，成都临岷江。尤其是第二点非常重要，因为这涉及到军防。
成都所临的岷江在明朝末年徐霞客之前被认为长江上游，从成都顺岷江往南可至岷江畔的犍为郡（彭山）、南安（乐山）、僰道（宜宾），并可以顺长江东下。重庆也是如此，从重庆顺长江东下可至荆湖、江东，溯长江西进可致僰道、成都，逆嘉陵江北上可至垫江（重庆合川）、安汉（南充）、阆中、广汉（射洪）、汉昌（巴中），水路交通可谓四通八达。
还有一点，重庆对成都来说具有门户作用。历代在蜀中建国者多定都于成都，蜀国一般有两个敌人：北方的中原王朝和东边的江东王朝。以蜀汉为例，蜀汉为防御曹魏可北守汉中，防御东吴可东守永安（重庆奉节）。不过奉节规模较小，一旦被吴军突破，吴军就可溯长江西进至重庆。
如果蜀军守住重庆，就能阻止吴军向西进入四川盆地的腹地，如果吴军攻破蜀军，成都就将门户洞开。刘备率兵入川遭到抵抗形势不利，守荆州的诸葛亮被迫带着张飞、赵云入川。荆州兵在攻下了严颜镇守的巴郡后，才势如破竹进入蜀中腹地的。
现在的重庆是我国西南地区的中心城市之一，在近代以前，重庆依然是与成都并列的西南地区中心城市，只不过成都要么是国都，要么是省会，比重庆级别略高一些。但重庆之于成都的门户意义，历经两千年没有太大的变化。
无论哪朝哪代，重庆都是西南地区的大郡（大府），无论是军事地位还是经济地位。到了南宋后期，巴蜀被元军冲得稀里哗啦，名臣余玠出管重庆府，他死守重庆，巩固长江上游的防线。时人云：“蜀之根本在重庆。”
重庆以东的涪陵位于长江与乌江汇流之处，地势非常险要。不过在涪陵距离四川盆地较远，无法承担起四川盆地东部的中心城市作用。位于重庆东北部的万州也有长江之利，但万州建城比重庆晚，蜀汉建兴年间才设南浦县。而且万州也位于四川盆地的东部边缘，距离江东控制的荆州过近，在古代的蜀中地理来说，这不是一个理想的安全位置。
重庆所在的位置不南不北，不东不西，有大河有大山，还有肥沃的平原，是非常适合成为中心城市的。
重庆的地形地貌
重庆北有大巴山，东有巫山，东南有武陵山，南有大娄山。重庆主城区海拔高度多在168～400米之间。市内最高峰为巫溪县东部边缘的界梁山主峰阴条岭，海拔2796.8米；最低为巫山县长江水面，海拔73.1米。
重庆境内山高谷深，沟壑纵横，山地面积占76%，丘陵占22%，河谷平坝仅占2%。其中，海拔500米以下的面积3.18万平方千米，占幅员面积38.61%；海拔500～800米的2.09万平方千米，占幅员面积的25.41%；海拔800～1200米的1.68万平方千米，占幅员面积的20.42%；海拔1200米以上的1.28万平方千米，占幅员面积的15.56%。