男性不育的临床病因多种多样，其中首要因素是生殖道感染。持续存在的附属器官感染或生殖道炎症，会对精液的指标产生显著影响，导致不育问题的出现。
染色体异常也是导致不育的重要原因，男性染色体的异常会直接影响精子的数量、活力和形态，这些都可能成为孕育路上的障碍。
阴囊温度的管理不容忽视，长时间处于过高温度，或是遭受放射性、化学物质或药物的侵害，都会对精子的质量产生负面影响，进而影响生育能力。
自身的免疫反应也可能成为不育的元凶，当男性产生针对精子的抗体，会干扰精子的产生和正常运输，从而制约生育机能。
精索静脉曲张，由于影响睾丸局部温度升高，导致血管活性物质增加，对睾丸功能造成损害，这也是男性不育的原因之一。
隐睾，这是一种常见的先天性问题，隐匿的睾丸会影响精液质量，对于隐睾患者，及时的治疗至关重要。
最后，内分泌系统的正常运作对精子生成至关重要。性腺轴、垂体和下丘脑之间的任何功能障碍，都可能导致男性的内分泌失衡，从而间接影响生育能力。
精液异常性不育；精液由精子和精浆组成，其中精子占10%，其余为精浆。它除了含有水、果糖、蛋白质和脂肪外，还含有多种酶类和无机盐。精液中含有锌元素。在生育过程中，精子与卵子结合后形成受精卵，发育成胚胎，一个新生宝宝就是这样诞生。可见精子在繁殖生育中占着无足轻重的位置。精液异常性不育分为精液异常和精子异常两类，前者指精液量的多寡，颜色异常、质的异常，后者指精子量的多少，质的异常、畸形等。