我首先表明，自己一贯反对用科学的名词或者理论来解释宗教内容。但是因为很多人有这方面的困惑，所以我也说几句自己浅显的认识。
1、对于科学的确切理论，我们其实都没有真正通透，因为我们讨论的，都是别人加工过的东西；比如，关于时空穿梭、空间平行，我们都是从一些科普杂志上面了解的，未必很准确。但是，这个问题并不严重。
2、一味追求将宗教内容和现代科学相联系，其实容易走入误区，而且容易被非法的东西蒙骗。因为现在很多邪教或者正经宗教的“邪师”就喜欢用科学的名词来解释自己的一套骗人的理论，让听、看的人云里雾里、不知所云，最后因为钦佩而被欺骗。
3、宗教理论的根基和科学的根基是完全对立的。融合两者的理论是非常危险而且很难的事情。
宗教是彻底唯心的，唯心的宗教的基础。而唯物是目前科学的基础。唯心与唯物的关系，不论再哲学上还是科学理论上，都是完全对立的。
融合的危险就是：对于宗教来说，容易理解偏差甚至错误，对于修行有大妨碍，甚至走火入魔；对于科学来说，容易背离科学准则，掀翻科学实证的根本基石，转到伪科学的境地。
4、关于科学和宗教到底谁说的最准确最正确等等的问题，其实目前是无法说清的。正因为说不清楚，所以才会有宗教和科学的划分。我个人认为，一切都是缘分，不可强求。
5、对于宗教和科学的关系，我一直认为，可以以世俗和宗教的关系来处理。比如，我怀有出世思想，但是对于我目前所有世间的俗务不会有很大影响，一切都是相互分开的。
很高兴看到楼主的问题，我认为，很多大乘佛经里面都有类似这种问题的描述，只是一般人没有注意。而且因为我自己读的书也很少，所以也只能说自己以为符合楼主问题要求的一小部分解答：
1、关于世界实相的解释。就是佛教认为，一切都是心显现的幻象，世界本质是一种不生不灭，不垢不净、不增不减、非有非空，非非有非空的状态。因此，什么时空问题，在修行证悟者眼中，不是问题。只是虚幻的表象。
2、佛经常说，佛的境界是十方三际一如。在《普贤菩萨行愿品》中就说，佛常以一念入三世。这里三世，就是前世、现世和来世。应该就是我们所谓穿梭时空。
3、关于其他世界的问题。佛教一直说，我门这个世界只是很多很多世界中的一个，还有同样的世界以及不同的世界。我们因为自己恶业障蔽了眼睛，无法看到。每次佛讲法的时候，就会有很多他方世界的菩萨、罗汉等飞来听讲经。这应该就是飞跃时空的情况了。
4、《妙法莲华经》、《地藏王菩萨经》等 里面谈到了其他世间的菩萨来我们世界，听释迦牟尼佛讲法的事情。
《华严经－－普贤菩萨行愿品》里面谈到了佛的境界“三际一如”的事情 。
还有部分高僧大德编写了一些讲义（浓缩了《华严经》等经书的内容），谈到6道轮回中，天人道（仙）、鬼道和人间距离的事情，因为业力，虽然就在身旁却看不到，这大概就是你所谓“空间平行理论”了。谢谢！
参考资料：百度知道: 飞龙在天金刚心 - 举人 四级 10-21 13:47