国家重点实验室在行政上是正厅级。
国家重点实验室是专注于某一行业、某一领域研究的单一性实验室，依托于高校、科研院所、大型企业。比如“电力系统及发电设备控制和仿真国家重点实验室”就是依托于
清华大学，专注于电力系统、发电设备的研究，出成果然后转化为实际应用，是简单的线性关系，不具有国家实验室交叉、共享等特点。目前，国家重点实验室的数量有300个左右而且还在不断增加。根据科技部的文件精神，最终数量可能达到700个左右，从此也能从侧面看到国家实验室和国家重点实验室的差距。
依托于内地高校的国家重点实验室共有185个，分布在75所高校。其中清华大学、
浙江大学、北京大学、南京大学、
上海交通大学分别拥有11个、10个、9个、7个、7个，在数量上位居前5。虽说数量上远多于国家实验室，但是国家重点实验室也是很“稀有的”，可以较大程度上代表高校的科研实力（不少
211工程高校一个国重实验室也没有）。