合肥南站可以刷二代身份证进站乘坐高铁的。
但是需注意以下事项：
凭居民二代身份证原件直接进出站和乘车需要满足以下的乘车条件：
1.必须是网上订票，并且是使用居民二代身份证。
2.网上订票后没有换取纸质车票，已换成纸质车票票的就不能再刷身份证检票，而是只能刷票检票。
3.身份证可以正常的刷卡未退磁或者功能感应故障。
满足上述条件就可以使用二代居民身份证原件直接在车站自动检票机办理进、出站检票手续，无需换取纸质车票。
详细是否可以免取纸质车票直接用二代身份证原件检票乘车以注册手机短信和邮箱提示内容为准。
合肥南站是可以的。需要注意的是直达车，和特快车等车是需要取票的。
合肥南站综合交通枢纽项目(以下简称“合肥南站枢纽”)是结合高铁合肥南站建设的集各种交通换乘方式为一体的大型综合交通枢纽，属合肥市先行规划设计的重点项目之一。
高铁合肥南站将连接通过合肥市的合宁、合武两条高速铁路，其旅客发送量占合肥铁路总旅客发送量的67%以上，根据相关资料预测结果，2020年和2030年合肥南站旅客发送量分别为1800万人和3160万人，旅客日发送量分别49315人和86575人，高峰小时客流量分别为5200人/时和9500人/时。
合肥高铁南站的建设将会大大提升合肥市的铁路交通枢纽地位，2014年11月12日建成通车。