工程结算需要计提的会计科目主要包括合同毛利和合同费用。这是因为工程结算是施工企业按照合同规定的内容全部完成所承包的工程，经验收质量合格，并符合合同要求之后，向发包单位进行的最终工程款结算。
在这个过程中，根据会计准则，施工企业需要设置“工程结算”科目，以核算企业承包工程实现的工程收入结算情况。该科目应按工程施工合同设置明细账，进行明细核算。
合同毛利和合同费用则是工程结算过程中的两个重要会计科目。合同毛利是工程施工的明细科目，工程结算是归集科目。合同毛利借方余额反映的是工程亏损，贷方余额反映的是工程盈利。
合同费用则包括从合同签订开始至合同完成止所发生的、与执行合同有关的直接费用和间接费用。这些费用都需要在工程结算时进行计提和处理。综上所述，工程结算需要计提的会计科目主要包括合同毛利和合同费用。