南京客运南站是汽车站，
南京南站通指火车站。包括高铁南站，地铁南站。
南京汽车客运南站位于南京市雨花台区玉兰路98号，是南京南部新城核心区，比邻亚洲最大高铁站南京南站，是南京交通运输系统以政府投资方式组建的站运分离的一级社会公用型车站， 是中国首家实现火车、长途客运、地铁、市内公交、出租车、社会车辆等6种运输方式无缝链接和零距离换乘的新型智能化综合枢纽汽车客运站，列为国家重点示范工程。
南京汽车客运南站是一级客运站，设有发车位23个，检票口21个，售票窗口22个，配备直升电梯及多部扶手电梯。营运班线辐射范围覆盖六省，平均日发送旅客约15000人次，发送班车780个班次。
从2014年开始，南京市北有南京汽车客运站，南有南京汽车客运南站，两者通过南京地铁1号线、南京地铁3号线连接，而且都是南京市的综合陆路交通枢纽。
旅客可乘坐南京地铁1号线、南京地铁3号线、南京地铁S1号线至南京南站到达。南京汽车客运南站紧靠南京火车南站，10分钟之内步行可实现普铁、动车、高铁、长途汽车与公交车、出租车、地铁、机场大巴的无缝换乘。
南京南站位于南京市雨花台区玉兰路98号，南京南部新城的核心区，是全国铁路客运特等站，连接8条高等级铁路的国家铁道枢纽站，南京南站占地近70万平方米，总建筑面积约45.8万平方米，其中主站房面积达28.15万平方米，是亚洲第一大火车站和亚洲第一大高铁站。
南京南站为京沪高速铁路五大始发站之一，是中国华东地区最大的交通枢纽，并为京沪高速铁路、沪汉蓉高速铁路、沿江高铁、宁杭城际铁路、宁通高铁、宁安城际铁路、宁合城际铁路、宁启城际铁路的客运枢纽站。
旅客可乘坐南京地铁1号线、南京地铁3号线、南京地铁S1号线至南京南站到达，南京南站紧靠南京汽车客运南站，10分钟之内步行可实现普铁、动车、高铁、长途汽车与公交车、出租车、地铁、机场大巴的无缝换乘。