法律分析：（1）司法机关和行政机关都由人民代表大会产生，而这之间没有隶属关系，但存在着监督与互相支持工作的关系。
（2）行政机关主要包括各级人民政府及其职能部门，而司法机关则主要由各级人民法院和检察院构成。至于公安局的性质比较特殊，当其在依据行政法律规范执行行政管理职能时，被认定为是行政机关，而当其依据刑事法律规范行使刑事侦查职能时，被认定为是司法机关。
（3）行政机关行使的是行政管理职权，而司法机关中法院依法行使审判职权，检察院依法行使法律监督职权和一定范围内的刑事侦查职权，公安机关依法行使部分刑事侦查职权。
（4）行政机关实行首长负责制，而司法机关中法院和检察院则实行集体负责制
法律依据：《中华人民共和国行政诉讼法》 第一百五十八条 行政机关根据法律的授权对平等主体之间民事争议作出裁决后，当事人在法定期限内不起诉又不履行，作出裁决的行政机关在申请执行的期限内未申请人民法院强制执行的，生效行政裁决确定的权利人或者其继承人、权利承受人在六个月内可以申请人民法院强制执行。享有权利的公民、法人或者其他组织申请人民法院强制执行生效行政裁决，参照行政机关申请人民法院强制执行行政行为的规定。