黍稷的籽粒是由子房通过受精的胚珠，与内外稃一起发育形成的。外层覆盖物为内外稃，光滑而坚硬，具有黄、红、灰、褐、白和复色等10多种颜色。我国8020份黍稷种质资源中黄粒的2721份，占33.93%；白粒的1767份，占22.03%；红粒的1443份，占17.99%；褐粒的1066份，占13.29%；复色粒560份，占6.98%；灰粒的463份，占5.77%。内外稃占籽粒重量的百分率，为皮壳率，我国黍稷籽粒的皮壳率一般为15%～20%。皮壳率的高低主要取决于品种特性和籽粒的饱满程度，也与籽粒种皮颜色有一定的相关性，一般白壳的皮壳率低，黑壳或红壳类型的皮壳率就高。籽粒去掉内外稃后就是米粒，具有黄、淡黄和白三种颜色。我国8020份黍稷种质资源中，黄米粒的5492份，占68.48%；淡黄米粒的2351份，占29.31%；白米粒的177份，占2.21%。籽粒中部有明显的凹沟，背部隆起，凹沟自基部向上延伸至中部，为胚所在的位置。腹面光滑平坦，在基部有一凸起的种脐，是种子萌发时胚芽伸长之处。
黍稷的籽粒形状有球形、卵圆形和长圆形三种。我国黍稷种质资源多为卵圆形，籽粒较小长2.5～3.2mm，宽2.0～2.6mm，厚为1.4～2.0mm。千粒重一般为3～10g，我国黍稷种质资源的千粒重平均最高为7.74.70g，为内蒙古自治区的品种；最低为黑龙江的品种，为6.13.98g。粳性籽粒较糯性籽粒略高。