在《倚天屠龙记》一书的最后一章，金庸老先生描写了张无忌如何按照武穆遗书所述，在少室山指挥武林群雄智退元兵，而后明教徐达、常遇春领兵前来击破元军。明教在江湖中威望自此完全洗脱了魔教的称谓，与武林正派内斗停止。而明教手下坛主韩童山、徐寿辉、朱元璋此时已成为红巾军几只最强大的反元势力，星星之火，已成燎原之势。此时，论德行、论威望、论势力，张无忌离皇帝宝座已经无比接近了。
可是为何金庸先生却安排朱元璋用一个反间计就把张无忌给逼走，不仅让出教主之位，还隐遁江湖了呢？按照原著所述，张无忌被朱元璋用烈性蒙汗药迷倒，和赵敏绑在一个军帐之内。身怀九阳神功，得到胡青年的张无忌，竟然会被蒙汗药给迷倒，这是第一不解之处。
朱元璋在另外一个军帐，和常遇春、徐达两人商量，徐达、常遇春说的谋害的兄弟是韩山童的儿子韩林儿叛教之事。张无忌误以为徐达、常遇春说的是自己，感觉到遭到兄弟的出卖，心灰意冷，出走卸任。没有什么心计的张无忌被骗能够想得到，可是为何同在一起智计百出不输于黄蓉的赵敏也没看出阴谋呢？再不行，事后找徐达、常遇春确认也行啊。可是都没有发生，这到底是为什么？金庸先生自有他没说出来的理由。
第一，赵敏是看出玄机了的。但是赵敏本来就是蒙古人，肯定有不希望张无忌成为反抗自己民族父亲兄长的头号敌人。赵敏既然决定舍弃郡主身份，与张无忌浪迹江湖，肯定是舍弃了荣华富贵的。一个汝阳王府的郡主和皇后之间区别并不大，赵敏厌恶了那种生活很正常，她不想回到过去很正常。
第二，徐达是武穆遗书的继承人，和李靖一样的一代兵神。常遇春是义薄云天的好汉，和张无忌有过命的交情。两人为何在张无忌出走之后，没有主动找张无忌问明原因，澄清误会呢。因为在他们心中，朱元璋更适合做皇帝，更有承担‘驱除鞑虏，复我河山’的重任。兄弟之情、恩惠之情，让位与政治的考量。
第三，金庸先生不让张无忌当皇帝，是因为不适合。最大的原因是张无忌随遇而安，容易被外界干扰的性格特点。倒不是一定说‘胸无大志’，张无忌从小绝大部分长于隐居的生活，为了符合前后的人物性格一致性，张无忌可以被形势所迫当明教教主，但是成为不了张皇帝。称孤道寡是真正的孤家寡人，其性格必有枭雄薄情的一面。
这三个原因都是重要的因素，但是还不够。因为没办法解释，为何最后当皇帝不是杨逍，为何明教总坛众多武林高手竟然被一个武功卑微的明教坛主所逆袭，甚至在杨逍手上的明教完全没有对朱元璋产生任何实质性威胁，反而被灭教呢？最根本的原因，在于明教的组织、指导思想出现的问题。
先谈组织，明教的上层。教主之下，是逍遥二仙，光明左使杨逍，光明右使范瑶。逍遥二仙之下，有四大护教法王，几乎和逍遥二仙同级，分别是紫衫龙王黛丽丝，白眉鹰王殷天正，金毛狮王谢逊，青翼蝠王韦一笑。四大法王之外，有五散人，彭和尚彭莹玉，铁冠道人张中，冷面先生冷谦，布袋和尚说不得，周颠。
五行旗是护教卫兵，锐金旗、巨木旗、厚土旗、洪水旗、烈火旗，旗主各有各的特长，不已武功称雄。每旗估计人数在一两千左右。另外就是各地的坛主，韩童山、徐寿辉朱元璋均是坛主。
逍遥二仙并不比四大法王、五散人大，即使略大，也没有从属关系。不然，阳顶天失踪后，明教四分五裂，殷天正、韦一笑、五散人也不可能都不服杨逍。上层从属关系不强，整个明教可以说是一群乌合之众。其组织上还不如天鹰教，天鹰教的教主是殷天正，第二高手是师弟李天恒，但是位置却居殷野王、殷素素之下，可以说天鹰教是一个很明显的家族企业。虽然有些不公平，但是绝不会出现组织不清、权责不明的情况。成立二十来年的天鹰教势力比不上少林武当，但是比峨眉、华山还是可以的。
明教最大的问题在于，坛主的实力无法遏制。和丐帮不同，丐帮的各地分舵舵主都只管理本地的乞丐，没有什么机会晋升。但是明教干的是起兵造反，处处点火，自然有的坛主发展的快，有的被消灭。就类似现在的大公司，公司总部没办法对分公司进行制约，分公司强大之后，自然对总公司进行反噬。这是朱元璋以‘奸计’逼走张无忌，明教之后却没办法翻盘的最大原因。
另外一个就是明教的组织思想，明教也被称为摩尼教，是佛教的一个分支。教众吃素不说，其指导思想有这么一首歌诀‘焚我残躯，熊熊烈火。生亦何欢，死亦何苦。为善除恶，维光明故。喜乐悲愁，皆归尘土。怜我世人，忧患实多。怜我世人，忧患实多。’这首歌诀意思不好懂，大致意思上，一种生死虚无，看破红尘，怜悯世人的思想。
可是造反，要的不是吃素，不是普度众生的悲悯，而是赤裸裸的利益。这是徐达、常遇春明知朱元璋奸诈无比，一代枭雄，还跟着朱元璋打天下的原因。
朱元璋能够逼走张无忌，有个人性格的原因，但这只是表象，更深层次的是明教的组织、教义都不足以让他成为造反成功。即使张无忌野心勃勃，皇帝之位还是得拱手相让。
在朱元璋逼走张无忌这一段中，朱元璋抓住张无忌软弱心慈的弱点。用了一个很好的计谋，同时计算了张无忌、徐达、常遇春三人。
而这计谋中的牺牲品就是小明王韩林儿，最好张无忌伤透了心，顾及反抗暴元的大业，不愿杀了朱元璋。最后把教主之位传给杨逍，之后朱元璋羽翼丰满后夺了明教教主之位成为了皇帝。