二套房商贷能用公积金还款，但前提是贷款人的公积金缴存正常，没有发生停缴以及缓缴的情况;另外，借款人需要正常归还二套房商业贷款达到两个月以上，而且还款信用良好，商业贷款没有逾期的纪录;此外，还需要在还清首套房房贷的基础上才可以进行申请。
公积金还商贷的方式用公积金还商业贷款有两种方式：提取还贷和委托冲贷。
一、提取还贷
提取还贷是指借款人从自己的公积金账户中提取一定金额的公积金，用于归还商业贷款的本息。一般来说，每年只能提取一次公积金，且每次提取金额不超过当年应还商业贷款本息总额。
1、所需材料
(1)借款人及配偶(如有)的身份证和户口簿;
(2)借款人及配偶(如有)的结婚证或者离婚证;
(3)借款人的公积金卡或者存折;
(4)借款人的商业贷款合同及还款计划表;
(5)借款人的房屋产权证或者不动产登记证明。
2、提取渠道
(1)网上申请
借款人可以通过当地公积金中心的官方网站或者手机APP进行在线申请，填写相关信息并上传所需材料，审核通过后即可到指定银行领取提取金额。
(2)窗口申请
借款人可以携带所需材料到当地公积金中心或者指定银行的窗口进行现场申请，审核通过后即可领取提取金额。
(3)自助申请
借款人可以通过当地公积金中心或者指定银行设置的自助终端进行申请，扫描身份证和公积金卡并输入相关信息，审核通过后即可领取提取金额。
二、委托冲贷
委托冲贷是指借款人委托银行或者公积金中心从自己的公积金账户中直接划拨一定金额的公积金，用于归还商业贷款的本息。这种方式相当于借款人将公积金作为一种还款来源，需要经过银行或者公积金中心的审批，并且签订相关协议。
1、所需材料
(1)借款人及配偶(如有)的身份证和户口簿;
(2)借款人及配偶(如有)的结婚证或者离婚证;
(3)借款人的公积金卡或者存折;
(4)借款人的商业贷款合同及还款计划表;
(5)借款人的房屋产权证或者不动产登记证明;
(6)银行出具的加盖公章的《对冲还贷申请表》。
2、委托冲贷流程
(1)借款人到原办理商业贷款的银行申请委托冲贷，并填写相关表格。
(2)银行审核借款人的资格和条件，并出具相关证明。
(3)借款人携带相关材料到当地公积金中心办理委托冲贷手续，并签订相关协议。
(4)公积金中心审核借款人的资格和条件，并确认相关协议。
(5)公积金中心每月按照协议从借款人的公积金账户中划拨固定金额的公积金，直接归还给银行。