首先，从学术研究的角度来看，姚班无疑更侧重于理论研究，特别是理论计算机科学领域，如博弈论、量子计算和计算经济学。相比之下，贵系虽然在本科阶段科研机会也不少，但理论研究的深度和广度可能不及姚班。然而，贵系在实践性课程上却有着丰富的资源，如机器视觉、自然语言处理等前沿技术，这些在姚班可能需要通过校外资源或工作经历来接触。
在算法竞赛方面，两者并无显著差异，清华的ACM团队组织水平相当，无论是姚班还是贵系，都有出色的竞赛传统。不过，姚班可能对参加国际顶级比赛更有优势，但校内的训练氛围可能会相对轻松一些。
课程设置上，贵系以其扎实的基础教育著称，从电子电路到操作系统，为学生提供了全面的计算机科学基础知识。而姚班则倾向于更前沿的课程，如博弈论和机器学习理论，尽管课程难度较大，但整体课量可能较少。不过，无论是哪个系，清华的学生们都倾向于通过自主学习和实践来深化理解。
在出国深造的机会上，姚班可能会提供更多的资源和支持，但贵系同样有能力帮助学生实现研究目标。实际上，无论选择哪个系，只要对科研有热情，出国做研究都不应成为决定因素。
最后，对于本科毕业后就业，无论是做码农还是其他领域，技术实力和实际项目经验往往比本科背景更重要。刷题和实践经验在找工作的过程中起着关键作用，但这并不意味着与系别选择直接相关。