1、思想认识不高，重视不够。
有的党组织对党建工作“说起来重要，做起来次要，忙起来不要”的思想，更有少数党政领导干部认为经济工作是“硬指标”，经济工作做好了，党建工作也做好，有一好遮百丑的倾向，并没有真正重视党建工作。
2、目标考核量化不细，没有具体衡量标准。
在党建工作责任制目标考核内容的设置上，任务量化指标较为笼统，导致在实际考核评价中，难以定位，考核模糊化，甚至可能出现工作做得好考核结果不理想，工作落实较差的考核结果靠前，本末倒置。
3、落实党建工作责任制措施不多，落实力度不够大。
部分党组织没有认真研究落实党建工作责任制的措施，工作简单，方法、点不多，对新形势下履行党建工作职责的能力较弱，作风飘浮，不深入基层，不深入实际，没有认真分析研究新情况、新问题，不能严肃对待和认真处理基层党建工作中的热点、难点问题。
4、监督管理不够，考核奖惩不严。
围绕履行党建工作责任制，县、乡党委都建立了一系列工作制度，但实际运行过程中，监督管理措施相对滞后，对制度落实不到位、职责履行不到位等问题，缺乏及时有效的监控措施和制约手段，在一定程度上影响了责任制的全面落实。
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二、对策
(一)加强引导，明确责任，增强管党意识。
实践证明，各级领导干部特别是主要领导干部的高度重视，直接决定了党建工作责任制的落实力度和工作成效。一是要加强领导干部抓党建的意识。加强党的建设，是全党的一项重大战略任务。
(二)实行目标管理，增强落实党建工作责任制的可操作性。
任何一项制度，是否具有可操作性，是真正落实的关键。一是工作责任要细化。抓基层党建工作责任不能笼统，要按照“分级负责，一抓到底”的原则，逐级分层签定党建目标责任书，层层分解目标，做到职责、任务和内容细化和具体化，既明确共性职责，又要区分不同层次和不同类型。
(三)强化制度建设，健全长效机制。
加强党建工作制度建设，是规范履职行为，推动工作落实，保证常抓不懈的重要手段和有效方法。落实党建工作责任制，就必须统一考虑、同步运行与之相配套的考核、奖惩、监督检查和责任追究等相关工作措施，做到督促检查有力度、考核有标准、奖惩有办法。
(四)加大投入，建立党建工作责任制落实保障机制。
一是要建立人员保障机制。调整充实党务工作人员，改善党务干部队伍的结构，使党务干部队伍更加适应新形势、新任务的要求，切实解决基层党建工作有人抓的问题。
二是要建立经费保障机制。增加党建工作经费的预算，并将经费纳入同级财政管理，建立基层党建工作经费投入机制，不断加大对基层组织开展活动、表彰奖励和设施等方面的投入，为基层党组织开展工作提供经费保障。
参考资料来源：贵州希望网-落实党建工作责任制过程中存在的问题与对策
本回答被网友采纳1、思想认识不高，重视不够。有的党组织对党建工作“说起来重要，做起来次要，忙起来不要”的思想，更有少数党政领导干部认为经济工作是“硬指标”，经济工作做好了，党建工作也做好，有一好遮百丑的倾向，并没有真正重视党建工作。
2、目标考核量化不细，没有具体衡量标准。在
党建工作责任制目标考核内容的设置上，任务量化指标较为笼统，导致在实际考核评价中，难以定位，考核模糊化，甚至可能出现工作做得好考核结果不理想，工作
落实较差的考核结果靠前，本末倒置。在落实党建工作责任制中，对哪些情况下要追究责任，责任追究主体不够明确，在责任主体的认定上，第一责任人、直接责任
人、具体责任人各自所负的责任模糊，难界定。
3、落实党建工作责任制措施不多，落实力度不够大。部
分党组织没有认真研究落实党建工作责任制的措施，工作简单，方法、点不多，对新形势下履行党建工作职责的能力较弱，作风飘浮，不深入基层，不深入实际，没
有认真分析研究新情况、新问题，不能严肃对待和认真处理基层党建工作中的热点、难点问题。落实党建工作责任制的投入不足。从人力投入上看，乡镇领导班子配
备改革后，党委副书记职数减少到一人，同时兼任纪委书记，还要负责群团、老年等工作，工作量成倍增加，分管副书记的精力投入不足，配备的党务干部，因人
少，多数党务干部都兼任2-3项工作，精神不能集中，抓落实的力度不大，满足于一般化和过得去。从财力投入上看，多数乡镇党委没有单独落实党建工作责任制
的工作经费和活动经费，工作推进的难度较大。
4、监督管理不够，考核奖惩不严。围
绕履行党建工作责任制，县、乡党委都建立了一系列工作制度，但实际运行过程中，监督管理措施相对滞后，对制度落实不到位、职责履行不到位等问题，缺乏及时
有效的监控措施和制约手段，在一定程度上影响了责任制的全面落实。如工作因安全生产、计划生育、烤烟生产等工作过失，受到责任查究和党内行政处分的领导干
部屡见不鲜，但在落实党建工作责任制方面还没有人受过处分。同时，基层党建工作的考核奖惩机制不完善，平时的督促检查指导工作开展不好，特别是考核结果运
用得不够充分，奖惩措施落实得不够严格，还没有在综合考评中凸显出党建工作责任制的落实情况。本回答被提问者采纳