雨花石的形成与地质、矿产、古生物等有关，是经过复杂的地质运动形成的。
雨花石是一种硅质岩类砾石，在火山爆发、地球岩浆活动中，含有二氧化硅的岩浆从地壳喷出，四处流淌，遇低温迅速冷却，凝固并留下孔洞，一些其他流体沿孔洞渗入岩石内部，逐渐分离、冷却，二氧化硅结晶成石英、玉髓等，便形成了雨花石原石。
雨花石的圈状花纹是二氧化硅胶液围绕火山岩空隙、空腔，由内壁开始，从外向内多层次逐层沉淀而成。由于热水溶液所含铁、铜、铬等微量元素，赋予了雨花石五彩斑斓、晶莹剔透的颜色。雨花石是一种天然玛瑙石，是南京市的著名特产，以“质、形、纹、色、呈象、意境”六美兼备而著称，被誉为“天赐国宝、中华一绝”。
雨花石真品特点：
1、色状：雨花石是一种天然的化石，就像琥珀，石头里面能看见很多自然的形状和颜色，现在能见较多的形状是条纹状，颜色以黄红绿白居多。如果能有风景或人物的形状在雨花石里面，那么这将是一个价值连城，极为贵重宝贵的佳品，很难得的。
2、形状：石头大家都见过，石头不可能有规则的形状，雨花石一般以非规则的椭圆型为主，厚度不一。
3、硬度：雨花石的成分主要是二氧化硅，所以硬度极高。
4、重量：石头肯定是比较重的，拿在手上掂量掂量一般就能感觉出来。
以上内容参考：百度百科-雨花石
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