（1）敷磁法，分直接敷磁法和间接敷磁法两种。
直接敷磁法：以胶布或伤湿止痛膏将磁片固定在病变部位或穴位。选用穴位时一般选用患区或邻近部位的穴位，也可根据病情选用远隔穴位或循经取穴。贴敷用的磁片一般采用直径1厘米的圆形磁片。磁片的数量则根据具体病情及病变范围而定，一般1片至数片不等。
采用单磁片贴敷时，一般对磁片磁极的放置无严格要求。但采用双磁片贴敷时，则有对置法与并置法之分。对置法时，在患区两侧或相对应的穴位，使磁片的异名极相对置，即一个磁片的南极与另一个磁片的北极相对放置，如在腕部的内关穴与外关穴相对贴敷。对范围较大的病变可采用并置法，病变较浅者采用异名极并置，病变较深者采用同名极并置。异名极并置是一个磁片的南极与另一个磁片的北极接触皮肤。同名极并置是两个磁片的相同极接触皮肤。
间接敷磁法：磁片放在人体体表上时，磁片不直接接触皮肤，磁片与皮肤之间有一层隔垫物。间接敷磁法适用于对胶布过敏、需要磁片敷贴的时间较长或不便于使用胶布的部位（如：磁疗背心、磁疗乳罩、磁疗腹带、磁疗腰带、磁疗护膝等）。
敷磁法的疗程长短根据病情而定，一般8~15天为一疗程，需要时可延长至20天或30天。
（2）耳磁法：将磁珠或小磁片用胶布固定在耳穴上的方法称为耳磁法。一般每次贴敷一侧耳廓穴位，7~10天后可以改换贴敷另一侧耳廓穴位。磁珠的表面磁场强度为1毫特斯拉左右，小磁片的表面磁场强度为10~20毫特斯拉。耳磁法适用于神经衰弱、失眠、神经性头痛、胆石症、荨麻疹、痒疹等疾病的治疗。
（3）旋磁法：治疗时将旋磁机的磁头放置于病变处，每次治疗15~30分钟。也可将磁头放置于穴位上治疗，每次取穴2~4个，每个穴位治疗5~7分钟。每天治疗一次，10~15次为一疗程。
（4）磁处理水疗法：采用磁水杯进行磁处理水疗法时，先将普通饮水置于磁水杯中，经10~15分钟后即可饮用。一般每天共饮用2000~3000毫升磁处理水，早晨空腹先饮600~1000毫升，其余在日间分次饮用。磁处理水应当天制作，当天饮用。1~3个月为一疗程或更长时间。
注意事项：磁片不能受撞击、火烤，否则磁性将减退或消失；永磁体磁片可反复多次使用，因此每次用完后要妥善保存；不能使磁片接触手表，以免表内部件磁化而影响手表的准确度；在创面进行磁疗时，所用磁片或磁头需经消毒处理。可先用75%酒精浸泡1小时，然后使用；采用间接敷磁法时必须使磁片对准穴位或病变部位，否则将明显影响疗效，应用磁疗背心、磁疗腹带、磁疗腰带时尤应注意这一点。因每个人的身高及体型不同，一个型号的磁疗用品不可能适合所有的病人，所以购买市售磁疗用品时要根据病人的身材选择合适的型号。如果自己制作，宜先量好尺寸，再将磁片放在合适的位置，以便保持贴敷磁片的准确性；年老体弱的病人或头颈部进行磁疗时，为了避免副反应的发生，疗程开始时宜采用低强度磁场，磁片的表面磁场强度0.05~0.1特斯拉，不出现不适反应而疗效不明显时，可适当提高磁场强度；少数病人在磁疗中出现头晕、恶心、心慌、气短、发憋、低热等副反应，一般症状较轻，不作任何处理即可自行减轻或消失，不影响磁疗的进行。但个别病人的副反应较明显，减少所使用磁片的数量或降低磁场强度或缩短磁疗时间，即可避免副反应的发生。极个别病人在采取以上措施后副反应仍未减轻，此时即应停止磁疗，停止磁疗后副反应亦随之消失，不会出现任何后遗症；市场上有些磁疗用品的质量低劣，名不符实，购买时须加以注意。为避免购买假货，可在有磁疗知识的人员的指导下进行选购；首次进行磁疗或使用磁疗用品者应在医务人员指导下进行，以求治疗部位和剂量、方法准确，以获得预期的治疗效果。