对于员工迟到的，用人单位可以根据以下方式处理：1、在公司内设立
全勤奖，要是员工在当月没有迟到没有请假的，则可以有这笔全勤奖，那员工迟到的话，全勤奖就不会发放；2、可以将出勤跟绩效挂钩，要是员工迟到的可以扣绩效分；3、一般来说公司都会将出勤列入
规章制度的，迟到一次的可以不过问，迟到两次的是需要被警告的，要是迟到的次数很多，用人单位可以以劳动者严重违反规章制度的理由解除员工。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：1、在试用期间被证明不符合录用条件的；2、严重违反用人单位的规章制度的；3、严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；4、劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；5、因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；6、被依法追究刑事责任的。