主要区别为出口企业自己退税时间长，成本高，而代理退税可以节省时间和成本。
1、出口企业自己退税退税操作时间太长，还有退税不成功的风险。代理退税可代垫退税款，最快3天可以拿到钱，解决资金周转问题。
2、出口企业自己退税流程复杂麻烦，请专业的外账财务退税成本高。代理退税专业的退税团队管控退税流程，帮你做好退税资料。最少节省2个财务工资。
3、出口企业自己退税出口报关环节没有人指导，出口数据有一点小失误才会导致退税不成功。代理退税专人上门跟进指导每个退税流程及环节注意事项，提前控制退税风险，100%拿到退税款。
扩展资料：
出口企业退税流程
1. 有关证件的送验及登记表的领取
企业在取得有关部门批准其经营出口产品业务的文件和工商行政管理部门核发的工商登记证明后，应于30日内办理出口企业退税登记。
2. 退税登记的申报和受理
企业领到“出口企业退税登记表”后，即按登记表及有关要求填写，加盖企业公章和有关人员印章后，连同出口产品经营权批准文件、工商登记证明等证明资料一起报送税务机关，税务机关经审核无误后，即受理登记。
3. 填发出口退税登记证
税务机关接到企业的正式申请，经审核无误并按规定的程序批准后，核发给企业“出口退税登记”。
4. 出口退税登记的变更或注销
当企业经营状况发生变化或某些退税政策发生变动时，应根据实际需要变更或注销退税登记。
参考资料：百度百科-出口退税流程
区别如下：
1、出口企业自己退税首先要有专业的财务团队对出口退税流程非常熟悉。退税流程操作经验丰富。如果是新企业退税金额比较高的这种税局调函可能性100%，退税时间非常久，像不发函的情况下最少都要3个月左右才能拿到退税款，如果发函了退税时间就相应延长很多。
2、代理退税可以帮企业解决很多问题。专业的退税团队管控退税流程，帮你做好退税资料。最少节省2个财务工资。专人上门跟进指导每个退税流程及环节注意事项，提前控制退税风险，100%拿到退税款。可代垫退税款，最快3天可以拿到钱，解决资金周转问题。
扩展资料
出口企业要自己退税首先要有一个展业的财务团队。退税操作时间长，退税款拿到的慢。退税环节没人指导，容易出现错误。退税时间过长，资金周转困难。
企业出口退税流程：
1. 有关证件的送验及登记表的领取。企业在取得有关部门批准其经营出口产品业务的文件和工商行政管理部门核发的工商登记证明后，应于30日内办理出口企业退税登记。
2. 退税登记的申报和受理。企业领到“出口企业退税登记表”后，即按登记表及有关要求填写，加盖企业公章和有关人员印章后，连同出口产品经营权批准文件、工商登记证明等证明资料一起报送税务机关，税务机关经审核无误后，即受理登记。
3. 填发出口退税登记证。税务机关接到企业的正式申请，经审核无误并按规定的程序批准后，核发给企业“出口退税登记”。
4. 出口退税登记的变更或注销。当企业经营状况发生变化或某些退税政策发生变动时，应根据实际需要变更或注销退税登记。
参考资料：百度百科-出口退税流程
本回答被网友采纳出口企业自己退税即自己公司有进出口权，可以自行办理退税。
代理退税指的是代理公司代理出口，代理公司得到退税后返回给委托人。很多人不理解这种操作的模式，认为自己能退为什么要找代理来做退税。下面解释下：
出口代理有专业的团队，退税流程熟悉，代理公司一般税务级别都是A级以上，退税速度快，并且专业的代理都有垫退税的服务。即把退税资料条件满足后3天内代理即可把退税款打给委托方。
注意：如果选择出口企业自己退税，一定要有专业的财务人员办理，退税资料不合规或者流程不熟悉不仅影响退税速度，还可能会造成退不下来的情况。
出口代理操作流程如下：
1，企业或者个人和代理公司签署代理协议，明确责任和货权。
2，安排外汇打到代理在国内的正规合法账户，代理应当在收到外汇后的24小时以内结汇并且安排货款到工厂公司账户。（前提依据部分预付，剩余发货前付清的付款方式下）
3，工厂安排生产 （注意：因为代理只是作为出口操作服务方，对货物的生产质量把控并不做责任监督方）
4，货物生产后，代理应当配合工厂和货代完成发货报关工作，针对报关资料（箱单发票商检等）可以配合完成。
5，工厂开具增值税专用发票给代理，代理应当对工厂开票进行指导。（增票需和报关单一致）
6，增值税专用发票查验合格，报关结关，外汇收齐以后，及时办理退税并把利润一起结算给委托方。（代理提供的3天垫退税服务，需要在资料备齐后3天把退税款及时给委托方）
大型代理公司一般归属外综服务企业，除了代理出口还提供租船订舱的服务。专业的ERP系统，很好的保护了客户隐私。是目前对个人SOHO和中小企业很好的外贸出口平台。
出口企业自己退税首先要有专业的财务团队对出口退税流程非常熟悉。退税流程操作经验丰富。如果是新企业退税金额比较高的这种税局调函可能性100%，退税时间非常久，像不发函的情况下最少都要3个月左右才能拿到退税款，如果发函了退税时间就相应延长很多了，如果调函结果不理想，有的上一年都不一定退税成功。
出口企业退税经常遇到以下这些问题：
1、企业自己退税流程复杂麻烦，请专业的外账财务退税成本高。
2、出口报关环节没有人指导，出口数据有一点小失误才会导致退税不成功。
3、退税操作时间太长，还有退税不成功的风险。
4、退税时间长导致退税款拖延，企业资金周转难。
而代理退税可以帮企业解决这些问题：
1、专业的退税团队管控退税流程，帮你做好退税资料。最少节省2个财务工资。
2、专人上门跟进指导每个退税流程及环节注意事项，提前控制退税风险，100%拿到退税款。
3、可代垫退税款，最快3天可以拿到钱，解决资金周转问题。
4、外汇到账0延误，由企业自己操作，随时可以结款。1美金补贴3分钱可以多赚钱，降低出口成本。
5、还有增值服务，无需抵押担保就可以贷款。本回答被网友采纳
一般来说，年出口量200w美元一下的中小企业，前期自己办理进出口成本较大。
要考虑到财务、核销、操作、人员成本以及和银行、海关、税务沟通的成本，把流程这部分交给代理来操作成本会更低，效率更高。
也有些公司一开始会觉得，可能目前业务量并不大，但是以后很可能会做大，所以对和我们代理合作不是很感兴趣。
我的回答是:"若贵公司以后发展到一定规模，届时有必要也可以再去聘请自己的团队，但是现在选择通过我们代理出口，首先可以节约成本，提升效率。
更重要的是，因为外贸代理可以垫付退税，而自行向税务局申请退税至少要三个月到半年时间，对于有些地区的公司来说，可能要更久的时间。
这笔退税的资金时间成本只需要客户付出一定金额的代理费。而这笔代理费本身就比贵公司现在聘请一个团队的成本低。"
因此一些客户即便有进出口权，也继续选择我们做外贸代理。
所以为何不选择外贸代理呢？我想一些公司或者SOHO的顾虑主要在于不确定代理的服务质量和信誉，是不是能保证货物资金以及客户信息安全。
对于我们这类正规代理公司来说，和客户一起成长，互惠互赢才是长久发展之道，而出卖客户信息，保证不了资金货物安全，就无法长期稳定合作，互惠互赢。
至于如何甄别代理公司，一般来说建议选择资历久，规模大，收费较为合理的外贸代理比较稳妥。