两个各有各的好处。需要根据别墅的具体布局，卫生间数量以及热水用量大小来综合确定。
如果一次用热水量较大或者是有浴缸，建议安装燃气热水器，可以持续出热水；如果卫生间燃气不方便，且是多个卫生间分开安装并用热水的，建议安装电热水器。
对于小型别墅来说，其实还有更好的方案，比如装燃气壁挂炉来同时满足采暖、用热水需求，也可以充分发挥别墅的优势安装太阳能热水器，用带电加热的类型，在天气不好的时候开启电加热供热水。
多个卫生间，不是集中供热水的话，建议分开不同的卫生间装热水器，方便的装燃气热水器，不靠近燃气管道的装电热水器。